可以请求法院认定房管局出具的调配单合法有效，但需满足一定条件并遵循法定程序。具体分析如下：

1. 请求认定的法律依据
   根据《行政诉讼法》第六条，法院有权对行政行为的合法性进行审查。房管局作为行政机关，其出具的调配单属于具体行政行为，若相对人或利害关系人认为该行为侵犯其合法权益（如房屋所有权、使用权争议），可依法提起行政诉讼，请求法院确认其合法性。

2. 请求认定的前提条件

   • 主体资格：原告需与调配单存在直接利害关系（如房屋所有权人、承租人或受调配人）。
     
   • 时效限制：需在知道或应当知道行政行为作出之日起6个月内提起诉讼（《行政诉讼法》第四十六条），但因不动产提起的诉讼最长不超过20年。
     
   • 内容明确：调配单需具备具体行政行为的特征，即针对特定对象、明确权利义务且已送达相对人。若调配单仅为内部文件或未实际执行，可能因不具可诉性被驳回。

3. 法院审查的核心要点

   • 程序合法性：房管局作出调配单是否遵循法定程序（如听证、公示、送达等）。
     
   • 实体合法性：调配单是否符合上位法规定（如《城市房地产管理法》《公有住房管理条例》等），是否存在超越职权、滥用职权或主要证据不足的情形。
     
   • 目的正当性：调配单是否出于公共利益需要，而非滥用行政权力损害私人权益。

4. 实务建议

   • 证据收集：需提供调配单原件、房管局作出行为的依据（如政策文件、审批流程）、自身权益受损的证明（如房屋产权证、租赁合同）等。
     
   • 诉讼策略：若调配单存在程序瑕疵（如未告知救济途径），可主张撤销并要求重新作出；若实体违法（如违反分配规则），可直接请求确认无效。
     
   • 替代方案：若诉讼成本过高，可尝试通过行政复议或与房管局协商解决，但需注意复议前置情形（如涉及自然资源确权）。

风险提示：若调配单已执行完毕且未损害他人合法权益，法院可能以“行政行为具有公定力”为由驳回请求。建议根据具体案情评估胜诉率后再行起诉。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程。