结论：小区井盖偷偷更换是否违法，需根据更换的主体、目的及行为性质综合判断，可能涉及民事侵权、行政违法甚至刑事犯罪。以下从不同角度详细分析：

一、若更换主体为物业或开发商，且未履行告知义务

1. 法律性质：可能构成民事侵权。物业或开发商作为小区公共设施的管理者，对井盖等设施负有维护、管理义务。若未经业主同意或未履行告知义务擅自更换井盖，可能侵犯业主对小区公共设施的知情权、监督权。
2. 法律后果：业主有权要求物业或开发商停止侵害、恢复原状或赔偿损失。若因井盖更换导致业主或他人人身、财产受损，物业或开发商需承担相应的赔偿责任。
3. 建议：业主可要求物业或开发商出示更换井盖的合法依据（如维修记录、业主大会决议等），若无法提供，可向业委会或相关部门投诉，必要时通过法律途径维权。

二、若更换主体为第三方（如施工队、个人），且未经许可

1. 法律性质：可能构成行政违法或刑事犯罪。若第三方未经物业、开发商或业主同意，擅自进入小区更换井盖，可能涉嫌破坏公共设施、盗窃或故意毁坏财物等违法行为。
2. 法律后果：根据行为性质和后果严重程度，第三方可能面临行政处罚（如罚款、拘留）或刑事追究（如盗窃罪、故意毁坏财物罪）。同时，若因井盖更换导致他人受损，第三方还需承担民事赔偿责任。
3. 建议：物业或业主发现此类情况应立即报警，并保留相关证据（如监控录像、现场照片等），以便后续维权。

三、若更换井盖出于安全或维修需要，但程序不合法

1. 法律性质：可能构成程序违法。即使更换井盖是出于安全或维修需要，若未按照相关规定履行审批、告知等程序，仍可能被认定为违法行为。
2. 法律后果：相关责任方可能面临行政处罚或民事赔偿。例如，物业未按规定程序更换井盖导致业主受损，需承担赔偿责任；若因程序违法被相关部门查处，还可能面临罚款等行政处罚。
3. 建议：更换井盖等公共设施时，应严格遵守相关规定程序，如提前告知业主、取得必要审批等。若因紧急情况需立即更换，也应在事后及时补办相关手续并说明情况。

四、特殊情况：井盖更换涉及公共安全或重大利益

1. 法律性质：若井盖更换涉及公共安全或重大利益（如防止井盖塌陷伤人、配合城市规划等），且相关责任方已采取必要措施确保安全并履行告知义务，则可能不构成违法。
2. 法律后果：在此情况下，即使更换井盖未完全符合某些程序性要求，也可能因涉及公共利益而得到豁免或减轻责任。但需注意，这并不意味着可以完全忽视程序要求，而是在确保安全的前提下尽可能履行相关程序。
3. 建议：在涉及公共安全或重大利益的井盖更换项目中，相关责任方应提前与业主、相关部门沟通协商，确保更换工作顺利进行并最大限度减少对业主的影响。

总结：小区井盖偷偷更换是否违法需根据具体情况判断。若您发现此类情况且担心自身权益受损，可直接向我咨询具体法律问题，我将根据您的描述提供更详细的法律分析和建议。