结论：国家扣电动车后将其卖掉是否合法，需根据具体情况判断，包括扣押程序是否合法、车辆是否属于应没收或拍卖范围等。以下从不同角度详细分析：
一、扣押程序合法性
合法扣押情形：
- 若电动车因违反交通法规（如闯红灯、逆行等）被交警依法扣押，且扣押程序符合《道路交通安全法》等相关规定，那么扣押行为本身是合法的。
- 若电动车涉及其他违法行为（如盗窃、抢劫等），被公安机关依法扣押，同样需确保扣押程序合法。
非法扣押情形：
- 若扣押行为未遵循法定程序，如未出示执法证件、未告知扣押理由等，则扣押行为可能违法。
- 若扣押的电动车与违法行为无关，或扣押行为超出法定权限，同样构成非法扣押。
二、车辆处理合法性
合法处理情形：
- 没收：若电动车属于违法所得或用于违法活动的工具，且法律明确规定应予以没收，那么在扣押后，经法定程序，可以依法没收并上缴国库或进行其他合法处理。
- 拍卖：若电动车因交通违法被扣押，且车主未在规定期限内接受处理或缴纳罚款，根据相关规定，交警部门可以依法对车辆进行拍卖，所得款项用于抵缴罚款或上缴国库。但拍卖前需确保车主已收到通知并有机会申诉。
非法处理情形：
- 未经法定程序拍卖：若交警部门或公安机关在未履行法定程序（如通知车主、公告拍卖等）的情况下，擅自将扣押的电动车卖掉，则构成非法处理。
- 处理与违法行为无关的车辆：若扣押的电动车与违法行为无关，或车辆价值远超应缴纳的罚款，却仍被卖掉，同样构成非法处理。
三、车主权益保护
- 查询扣押原因：车主有权向扣押部门查询电动车被扣押的具体原因和法律依据。
- 申诉与复议：若车主认为扣押行为违法或处理不当，可以依法向相关部门提出申诉或申请行政复议。
- 法律诉讼：若申诉或复议无果，车主还可以向人民法院提起行政诉讼，维护自己的合法权益。
建议：若您的电动车被扣押并卖掉，且您认为该行为违法或处理不当，建议您首先向扣押部门查询具体原因和法律依据，然后根据情况选择申诉、复议或法律诉讼等途径维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。