招投标意见函盖代理的章，在一般情况下是不被允许的，除非有特别授权或法律规定。以下从不同角度进行详细分析：

1. 招投标活动的正式性与严肃性：

   • 招投标活动是一项正式且严肃的法律行为，它涉及到合同的签订、履行以及各方当事人的权益保护。因此，在招投标过程中，所有文件、函件等都需要具备相应的法律效力，以确保活动的公正、公平和透明。
   • 意见函作为招投标过程中的一种重要文件，通常需要加盖招标人或投标人的公章，以证明其真实性和合法性。代理章虽然可以代表某个主体进行一定范围内的活动，但在招投标这种正式场合，其法律效力可能受到质疑。

2. 代理章的法律效力：

   • 代理章是代理人根据被代理人的授权而使用的印章，它代表了被代理人的意志和权益。然而，代理章的使用范围通常受到被代理人授权的限制，且需要在特定条件下使用。
   • 在招投标活动中，如果招标人或投标人希望使用代理章来签署意见函，必须确保代理人已经获得了相应的授权，并且该授权明确包括了签署意见函这一事项。否则，使用代理章签署的意见函可能被视为无效。

3. 相关法律法规的规定：

   • 根据《中华人民共和国招标投标法》等相关法律法规的规定，招投标活动应当遵循公开、公平、公正和诚实信用的原则。这意味着在招投标过程中，所有文件、函件等都需要真实、合法、有效。
   • 如果意见函上加盖的是代理章，且没有明确的授权或法律规定支持其使用，那么该意见函可能无法满足法律法规的要求，从而影响招投标活动的正常进行。

4. 实际操作中的建议：

   • 为了避免不必要的法律风险和纠纷，建议在招投标活动中，意见函等重要文件还是加盖招标人或投标人的公章为宜。
   • 如果确实需要使用代理章来签署意见函，那么必须确保代理人已经获得了相应的授权，并且该授权明确、具体、无歧义。同时，最好在意见函中注明代理人的身份和授权范围，以增加其透明度和可信度。

总结来说，招投标意见函上加盖代理章在一般情况下是不被允许的，除非有特别授权或法律规定支持其使用。为了确保招投标活动的顺利进行和各方当事人的权益保护，建议还是使用招标人或投标人的公章来签署意见函。如果您在招投标过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。