合同三份的分配通常取决于合同的性质、参与方以及各方的约定，但一般来说，会遵循以下原则进行分配：

1. 甲乙双方各持一份：

   • 在大多数合同中，甲方（通常是委托方、买方或需求方）和乙方（受托方、卖方或服务提供方）会各自持有一份合同原件。这是为了确保双方在合同履行过程中都能随时查阅合同条款，明确各自的权利和义务，从而保障双方的合法权益。
   • 示例：在房屋租赁合同中，房东（甲方）和租客（乙方）会各自持有一份合同，以便在租赁期间随时参考。

2. 第三份合同的灵活分配：

   • 第三份合同的归属则相对灵活，可能根据具体情况交给见证人、公证机构、金融机构、政府部门或双方共同信任的存档机构等。
   • 见证人或公证机构：如果合同涉及重要交易或需要第三方证明，可能会将第三份合同交给见证人或公证机构，以作为中立的第三方证明。
   • 金融机构：在涉及贷款或融资的合同中，金融机构可能会要求保留一份合同原件，以便进行风险管理和审核。
   • 政府部门：某些合同需要提交给政府部门进行备案或审批，如商品房买卖合同需要提交给房地产管理部门备案。
   • 存档机构：双方也可以共同选择一个信任的存档机构来保存第三份合同，以确保合同的公正性和安全性。
   • 示例：在一份涉及大额交易的买卖合同中，除了买卖双方各持一份外，第三份合同可能会交给公证机构进行公证，并保留在公证机构处。

特殊情况下的合同分配：

• 无需第三方的简单合同：如果合同仅涉及甲乙双方，且不需要第三方证明或备案，那么可能只需要签订两份合同，甲乙双方各持一份即可。
• 电子合同：随着数字化的发展，越来越多的合同采用电子形式签订。在这种情况下，三方可以通过云端访问电子合同，无需进行物理分配。但同样需要确保电子合同的安全性和可追溯性。
• 政府审批类合同：对于需要政府审批的合同，如工商注册、税务登记等，可能需要提交一份合同给相关部门进行审批或备案。剩余的两份则由甲乙双方留存。

法律建议与注意事项：

• 明确条款：在合同中应明确注明各方持有的合同份数及用途，以避免后续争议。
• 保密与安全：如果合同涉及商业秘密或个人隐私，应在合同中约定保密责任，并确保合同的安全存储，防止信息泄露。
• 法律效力：无论持有几份合同，所有正本都具有同等法律效力。如果需要使用复印件作为证据，应确保复印件加盖公章或签字确认，以证明其真实性。

总结来说，合同三份的分配应遵循基本原则，并根据具体合同性质和场景进行灵活调整。如果你有具体的合同类型或场景需要了解，可以直接向我咨询，我会为你提供更详细的解答。