在公司注销的情况下，与员工解除劳动合同（实际上应为终止劳动合同，因为公司注销导致劳动关系自然结束）需要遵循一系列法定程序，以确保员工的合法权益得到妥善保护。以下是一个详细且清晰的解答：
一、确认公司注销状态与法律后果
核实注销信息：
- 通过国家企业信用信息公示系统等官方渠道，查询公司的登记状态及注销清算公告，确认公司确已合法注销。
理解法律后果：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十四条的规定，当用人单位被吊销营业执照、责令关闭、撤销或决定提前解散时，劳动合同即行终止。因此，公司注销意味着劳动关系的自然结束。
二、办理终止劳动合同手续
书面通知员工：
- 公司应提前以书面形式告知员工公司即将注销以及劳动合同即将终止的事实，明确终止日期（一般以公司注销登记完成之日为准）。
通知工会（如设有）：
- 如果公司设有工会组织，需将终止劳动合同的方案通知工会，并听取其意见。
出具终止合同证明：
- 为员工出具终止劳动合同的证明，包含员工姓名、身份证号、工作岗位、工作年限、终止劳动合同的原因及日期等信息，并加盖公司公章。这是员工后续办理档案和社保转移的重要依据。
三、工作交接与薪资结算
安排工作交接：
- 安排员工与相关部门或人员进行工作交接，明确交接内容，并签署交接清单以确认交接无误。
结算薪资：
- 在终止劳动合同时，一次性结清员工的工资、奖金、补贴等应得收入，支付至员工工资账户。
四、经济补偿的核算与支付
核算经济补偿：
- 根据《劳动合同法》规定，公司因注销而终止劳动合同，需按员工在本单位工作的年限支付经济补偿。具体标准为：每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。
支付补偿：
- 在劳动者办结工作交接时，将经济补偿足额支付给员工，支付方式可与工资支付方式一致。
五、离职手续与档案社保转移
办理离职手续：
- 包括为员工办理社保和公积金减员手续，避免多缴或漏缴；要求员工归还公司工作证件、门禁卡等。
档案和社保转移：
- 为员工办理档案和社会保险关系的转移手续，确保其个人档案和社会保险的连续性。此过程通常应在终止劳动合同后15日内完成。
六、文件保存与法律责任
文件保存：
- 将员工的劳动合同、终止合同证明、工作交接清单、工资支付记录、经济补偿支付凭证等相关文件妥善保存，保存期限不少于两年，以备后续查询或纠纷处理需要。
法律责任：
- 如公司在注销过程中未依法履行上述义务，员工有权向劳动仲裁机构或法院申请裁决或强制执行。若公司在劳动仲裁前已注销，员工可将公司权利义务的承继者或有关责任人列为被申请人；若在仲裁过程中注销，则可变更或增加被申请人，请求有关责任人履行生效的仲裁裁决。
七、员工应采取的措施
查看合同条款：
- 员工应仔细查阅劳动合同，了解关于合同终止、经济补偿等条款的约定，以便在办理手续时心中有数。
与清算主体沟通：
- 若公司已进入清算程序，员工应找到清算主体（一般为股东），表明终止劳动合同的意愿，并协商经济补偿等事宜。
保留证据：
- 在整个过程中，员工务必保留好劳动合同、工作记录、考勤表、工资支付记录、沟通协商的记录等相关证据，以备不时之需。
八、争议解决途径
协商解决：
- 首先尝试与公司或清算主体进行友好协商，解决终止劳动合同过程中的问题。
劳动监察投诉：
- 若协商无果，且存在拖欠工资等损害员工权益的情况，员工可向当地劳动监察部门投诉。
劳动仲裁或诉讼：
- 如上述方法均无法解决问题，员工可收集相关证据，向劳动仲裁机构申请仲裁；对仲裁结果不满意的，还可向人民法院提起诉讼。
综上所述，公司注销时与员工终止劳动合同需严格遵循法定程序，以确保员工的合法权益得到充分保障。如有任何疑问或争议，建议咨询专业律师以获取更具体的法律指导。