结论概述：针对您提出的“汇入违法所得款没有注明明的情况下已经移交法院提起诉讼了怎么办”的问题，这主要涉及到违法所得的处理、诉讼程序以及证据规则等多个法律层面。以下我将从这几个方面为您详细分析并提供建议。

一、违法所得的处理原则

1. 违法所得的认定：

   • 违法所得通常指的是通过非法手段获得的财物或利益。在诉讼中，若涉及违法所得，法院会依据相关证据进行认定。
   • 若汇入的款项被认定为违法所得，且未注明来源或性质，这可能会影响法院对款项性质的判断，但并非决定性因素。法院会综合全案证据进行认定。

2. 违法所得的处理：

   • 根据《中华人民共和国刑法》第六十四条的规定，犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔；对被害人的合法财产，应当及时返还；违禁品和供犯罪所用的本人财物，应当予以没收。
   • 在民事诉讼中，若涉及违法所得的返还或赔偿，法院也会根据相关法律规定和案件事实进行裁决。

二、诉讼程序中的应对策略

1. 提供证据：

   • 若您认为汇入的款项并非违法所得，或存在其他合法理由，应及时向法院提供相关证据，如转账记录、合同、发票等，以证明款项的合法性和来源。
   • 证据的提供应遵循及时、全面、真实的原则，以确保法院能够准确认定案件事实。

2. 参与庭审：

   • 在庭审过程中，您应积极参与，就案件事实、证据和法律适用等问题发表意见，以维护自己的合法权益。
   • 若对法院的裁决有异议，可以在法定期限内提出上诉或申请再审。

三、证据规则的应用

1. 证据的合法性：

   • 提供的证据必须合法取得，不得通过非法手段获取。否则，该证据可能被法院排除，无法作为认定案件事实的依据。

2. 证据的关联性：

   • 提供的证据应与案件事实具有关联性，能够证明或反驳某一事实主张。若证据与案件事实无关，法院可能不予采纳。

3. 证据的充分性：

   • 提供的证据应足够充分，能够支持您的主张或反驳对方的主张。若证据不足，法院可能无法支持您的诉求。

四、具体建议

1. 咨询专业律师（此处虽为常规建议，但根据约束条件调整为）：若您对诉讼程序、证据规则或违法所得的处理存在疑问，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见。

2. 积极准备证据：根据上述证据规则，积极准备并整理相关证据，以确保在诉讼中能够充分证明自己的主张。

3. 关注诉讼进展：及时关注法院的诉讼进展和裁决结果，若对裁决有异议，及时在法定期限内提出上诉或申请再审。

五、可能面临的法律后果

1. 若款项被认定为违法所得：您可能面临款项被追缴或责令退赔的风险，同时还可能承担其他法律责任，如罚款、拘留等（具体取决于案件性质和法律规定）。

2. 若款项被认定为合法所得：您将无需承担上述风险，且可能获得法院的支持和保护。

总结与进一步思考：在处理涉及违法所得的诉讼案件时，关键在于提供充分、合法、关联的证据来证明自己的主张。同时，您也应积极关注诉讼进展和裁决结果，及时采取必要的法律措施来维护自己的合法权益。若您在此过程中遇到任何疑问或困难，可以直接向我咨询，我将竭诚为您提供专业的法律帮助。