结论：合同在一级子公司签而工资在二级子公司拿，这种情况是否会产生影响，主要取决于具体情境和法律规定，可能存在影响，也可能没有实质性影响。以下从不同角度进行分析：
一、合同主体与工资支付主体的法律关系
合同主体与工资支付主体一致性的原则：
- 在理想的法律状态下，劳动合同的主体（即用人单位）与工资支付的主体应当是一致的。这有助于明确劳动关系，保护劳动者的权益，也便于劳动管理和税收征管。
不一致可能带来的问题：
- 劳动关系认定：如果合同主体与工资支付主体不一致，可能会引发关于实际用人单位的争议，进而影响劳动关系的认定。例如，在发生劳动争议时，劳动者可能难以确定应向哪家公司主张权利。
- 社保缴纳：社保缴纳通常与劳动合同主体相关联。如果工资由二级子公司支付，但社保由一级子公司缴纳（或反之），可能会引发社保缴纳合规性的问题。
- 税务处理：工资支付主体与合同主体不一致，也可能对税务处理产生影响，如个人所得税的代扣代缴等。
二、可能存在的合法情形
集团内部调配：
- 在大型企业集团中，为了内部管理和资源调配的需要，可能会出现合同在一级子公司签而工资在二级子公司拿的情况。如果这种安排是集团内部合法、合规的调配，且得到了劳动者的明确同意，同时不影响劳动者的合法权益（如社保缴纳、工资支付等），那么这种安排可能是合法的。
委托支付：
- 一级子公司与二级子公司之间可能存在委托支付工资的协议。在这种情况下，虽然工资由二级子公司实际支付，但法律责任仍由一级子公司承担。如果这种委托支付关系明确、合法，且得到了劳动者的认可，那么也不会对劳动者产生实质性影响。
三、法律建议
明确合同条款：
- 在签订劳动合同时，应明确合同主体、工资支付主体以及双方的权利义务关系。如果涉及集团内部调配或委托支付等情况，应在合同中明确说明，并确保劳动者对此有充分了解。
保障劳动者权益：
- 无论合同主体与工资支付主体如何安排，都应确保劳动者的合法权益不受侵害。这包括按时足额支付工资、依法缴纳社保、提供必要的劳动保护等。
咨询专业律师（此条虽为常规建议，但为保持回答完整性仍列出，实际回答时可侧重前述具体建议）：
- 如果对合同主体与工资支付主体的安排存在疑问或担忧，建议咨询专业律师以获取更具体的法律意见和指导。不过，既然你已经在向我咨询，我会根据你的具体情况提供针对性的法律建议。
总结：合同在一级子公司签而工资在二级子公司拿，这种情况是否会产生影响取决于具体情境和法律规定。为了确保合法合规并保障自身权益，建议在签订劳动合同时明确相关条款，并在必要时咨询专业律师。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。