当电子眼抓拍到两轮车（包括电动车、摩托车等）的交通违法行为时，处罚措施会根据具体的违法行为、车辆类型以及发生路段的不同而有所区别。以下是一个详细且有条理的解答：

一、确认违法行为及车辆类型

首先，需要明确的是，两轮车可能涉及机动车或非机动车两种类型。机动车（如摩托车）的处罚通常更为严厉，而非机动车（如电动车、自行车）的处罚则相对较轻。同时，具体的违法行为，如逆行、闯红灯、超速等，也会影响处罚的力度。

二、机动车两轮车的处罚

1. 逆行：

   • 在普通道路上逆行：根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关规定，机动车驾驶人逆行一般会被扣3分，并处以20元以上200元以下的罚款。
   • 在高速公路上逆行：这是极其危险的行为，处罚也更为严厉。机动车在高速公路上逆行会被扣12分，并可并处200元以上2000元以下的罚款。

2. 其他违法行为：

   • 如闯红灯、超速等，也会根据具体情节和道路交通安全法规进行相应的扣分和罚款。

三、非机动车两轮车的处罚

1. 逆行：

   • 在非机动车道逆行：非机动车驾驶人逆行通常会被处以警告或5元以上50元以下的罚款。
   • 在机动车道逆行：这种情况性质更为严重，处罚力度也相应增大。非机动车在机动车道逆行可能会被处以警告或50元以上200元以下的罚款。

2. 其他违法行为：

   • 如闯红灯、不按规定车道行驶等，也会根据具体情节和道路交通安全法规进行相应的警告或罚款。

四、确认违章信息及缴纳罚款

无论机动车还是非机动车，被电子眼抓拍后，车主或驾驶人都需要通过以下方式确认违章信息：

• 访问交通管理部门的官方网站或使用官方APP（如“交管12123”）进行查询。
• 前往当地交警大队进行查询。
• 在收到的违法通知上查看详细信息。

确认违章信息后，需按照规定的时间去指定的部门进行罚款缴纳。缴纳方式主要分为线上和线下两种，包括使用交管部门指定APP、当地政务服务平台、微信或支付宝生活缴费渠道进行线上缴纳，或者前往银行柜台、交警大队违法处理窗口进行线下缴纳。

五、后续关注与处理

缴纳罚款后，请及时关注自己的交通违法记录，确保已处理并缴纳相应的罚款。若因特殊原因无法按时缴纳，应及时咨询相关部门了解延期缴纳的具体规定，以避免因逾期未处理而产生额外的费用或法律后果。

综上所述，电子眼抓拍两轮车的处罚措施会根据具体的违法行为、车辆类型以及发生路段的不同而有所区别。车主或驾驶人应严格遵守道路交通安全法规，确保行车安全，并在被电子眼抓拍后及时确认违章信息并缴纳罚款。