当两轮电瓶车（电动车）被电子眼抓拍到违法行为时，其处罚及处理流程主要依据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，并结合具体的违法行为来判定。以下是一个详细且清晰的解答：
一、具体违法行为及处罚
闯红灯：
- 处罚：根据地区交通管理实际情况，一般会对电动车驾驶人处以警告或者20元以上200元以下的罚款。
- 说明：闯红灯是严重的交通违法行为，极易引发交通事故，因此处罚相对较重。
逆行：
- 处罚：电动车逆行同样会面临警告或者20元到200元之间的罚款。
- 说明：逆行会严重扰乱交通秩序，增加与其他车辆发生碰撞的风险。
不按规定车道行驶：
- 处罚：如果电动车在机动车道行驶等不按规定车道行驶的行为，一般也会给予警告或者20元以上200元以下的罚款。
- 说明：电动车应在非机动车道行驶，以保障自身和他人的安全。
二、处理流程
接收通知：
- 电动车驾驶人通常会通过邮寄、电子邮件或短信等方式接收到交通违法行为的通知。
确认违法信息：
- 驾驶人需要仔细核对通知中的违法时间、地点、行为等信息，确保信息的准确性。可以通过访问交通管理部门的官方网站、使用官方APP（如“交管12123”）或前往当地交警大队进行查询。
缴纳罚款：
- 若确认信息无误，驾驶人应在规定时间内到指定银行或通过网络平台（如交管部门指定APP、当地政务服务平台、微信或支付宝生活缴费渠道等）缴纳罚款。
- 缴纳时，请携带或输入相关违法通知信息，并仔细核对支付信息，确保缴纳正确。
处理结果反馈：
- 缴纳罚款后，驾驶人应保留好缴款凭证，并关注处理结果的反馈。
- 如处理结果有误或存在疑问，应及时向相关部门咨询或申诉。
三、特殊情况处理
- 误拍或误判：如果驾驶人认为被电子眼误拍或误判，可以向交通管理部门提出申诉，并提供相关证据进行证明。
- 特殊情况下的违法：如车上载有急需就医的病人等特殊情况，驾驶人可以向交通管理部门说明情况，并提供相关证据，以争取减轻或免除处罚。
四、建议与提醒
- 电动车驾驶人在行驶过程中应严格遵守交通规则，避免违法行为的发生。
- 如不慎被电子眼抓拍，应及时按规定流程处理，以免产生不必要的麻烦和额外费用。
- 保留好相关证据和凭证，以便在需要时进行申诉或说明情况。
综上所述，当两轮电瓶车被电子眼抓拍到违法行为时，驾驶人应根据具体违法行为接受相应的处罚，并按照规定的处理流程及时处理。同时，也要了解并遵守交通规则，以维护道路交通的安全与秩序。