建筑工程质量验收不合格时，施工单位的赔偿金额并非固定数值，而是需依据合同约定、相关法律法规及实际情况综合判定。以下从不同角度详细分析赔偿金额的确定方式：

一、合同约定优先

若施工合同中明确规定了赔偿金额或计算方式，如约定因质量问题导致的损失按工程总价的百分比赔偿，或明确列出了各项赔偿费用的计算标准，则应按合同约定执行。这种情况下，赔偿金额的计算相对直接，只需根据合同条款进行核算即可。

二、法律法规为依据

在合同未详尽覆盖所有赔偿情形，或合同条款存在争议时，需依据相关法律法规进行裁决。主要涉及的法律法规包括《民法典》、《建筑法》以及《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》等。

1. 修复费用：

   • 若工程不合格但可修复，施工单位应承担修复费用，包括材料费、人工费等。修复后经验收合格的，发包人有权要求承包人承担修复费用。
   • 计算公式：修复费用 = 材料费 + 人工费 + 其他相关费用（如运输费、设备租赁费等）。

2. 工程价款与损失赔偿：

   • 若修复后经验收仍不合格，施工单位无权请求工程价款，并需对发包人因工程不合格遭受的损失承担赔偿责任。损失包括但不限于租赁替代场地的费用、生产延误损失、对第三方承担的违约责任等。
   • 损失赔偿计算：需根据实际损失情况，结合因果关系及可预见性条件进行评估。例如，生产延误损失可根据延误天数和每日生产利润计算；对第三方承担的违约责任可根据第三方索赔金额和施工单位过错程度分担。

3. 未经验收擅自使用的情形：

   • 若发包人未经竣工验收擅自使用工程，并以质量不符合约定为由主张权利，通常不予支持。但施工单位仍需对地基基础工程和主体结构质量在合理使用寿命内承担责任。
   • 赔偿范围：主要限于地基基础工程和主体结构质量问题的修复费用及相关损失。

三、综合考量因素

在确定赔偿金额时，还需综合考虑以下因素：

1. 不合格程度：工程质量不合格的程度越严重，对工程整体使用功能的影响越大，赔偿金额可能越高。
2. 对人身或财产安全的威胁：若工程质量问题对人身或财产安全构成威胁，赔偿金额可能包括因威胁导致的额外防范费用或潜在损失。
3. 双方过错程度：在确定赔偿金额时，需考虑双方过错程度。若发包人也存在过错，如未按合同约定提供施工条件或未及时支付工程款等，可能减轻施工单位的赔偿责任。

四、实例分析

假设某施工单位为某建设单位建造的商业楼存在墙面开裂问题，经修复后验收合格。修复费用包括材料费10万元、人工费5万元、运输费1万元，共计16万元。根据合同约定，施工单位应承担全部修复费用。因此，施工单位需向建设单位赔偿16万元。

若该商业楼主体结构存在严重质量问题，修复后仍不合格，导致建设单位无法按时开业，遭受生产延误损失50万元。根据法律法规和实际情况评估，施工单位需承担全部生产延误损失。因此，施工单位除无权请求工程价款外，还需向建设单位赔偿50万元。

总结：建筑工程质量验收不合格时，施工单位的赔偿金额需根据合同约定、相关法律法规及实际情况综合判定。在处理此类纠纷时，建议首先查阅合同条款，并收集充分证据以支持自己的主张。如有需要，可直接向我咨询，我将根据具体情况提供详细的法律建议。