关于补充协议远超原合同金额时原合同的效力问题，结论前置如下：
原合同在未被明确修改或废止的部分仍然有效：补充协议虽然远超原合同金额，但这并不意味着原合同整体失效。原合同中未被补充协议修改或废止的部分，仍然对双方具有法律约束力。
补充协议在合法且双方自愿、平等签订的前提下，其效力优先于原合同中相冲突的部分：如果补充协议的内容合法，双方均具备相应的民事行为能力，意思表示真实，且不违反法律法规的强制性规定和公序良俗，那么补充协议中关于金额的变更将优先于原合同的相关条款。
详细分析如下：
一、补充协议的性质与作用
补充协议是对原合同内容的补充、修改或变更，它体现了双方当事人在原合同基础上的新合意。当合同金额超出原约定时，双方完全有权通过协商一致，签订补充协议来明确超出部分的金额及相关事宜。这种变更在法律上是允许的，只要满足一定的条件。
二、补充协议效力的判断
合法性要求：补充协议的内容必须合法，不得违反法律法规的强制性规定和公序良俗。如果补充协议违反了这些规定，那么该协议可能被认定为无效或部分无效。
双方意思表示真实一致：补充协议的签订必须是双方自愿、平等的，且意思表示真实一致。如果存在欺诈、胁迫等情形，那么补充协议可能被撤销或认定为无效。
不损害社会公共利益：补充协议的内容不得损害社会公共利益，否则也可能被认定为无效。
三、原合同与补充协议的关系
原合同未被修改或废止的部分仍然有效：即使补充协议远超原合同金额，原合同中未被修改或废止的部分仍然对双方具有法律约束力。双方应继续履行原合同中未被变更的义务。
补充协议优先于原合同中相冲突的部分：在补充协议与原合同就同一事项（如金额）的约定不一致时，应视为双方以新的约定变更了原合同的相关条款。此时，补充协议的效力将优先于原合同中相冲突的部分。
四、实际操作中的注意事项
明确补充协议的内容：补充协议应明确、具体地约定金额超出的具体原因、超出金额的具体数额、支付方式和时间等关键条款。这有助于避免未来可能出现的纠纷。
遵循审批流程（如适用）：在大型建设项目、政府采购项目等复杂合同中，合同金额超支可能需要经过相关机构的审批。双方应遵循项目管理的相关规定和审批流程，确保补充协议的合规性。
及时咨询法律意见：在签订补充协议过程中遇到任何法律问题或疑问时，应及时向我咨询以获取更具体的法律意见和指导。
举例说明：
假设甲乙双方原签订了一份买卖合同，约定货物总价为100万元。后因市场变化，货物成本大幅上升，双方协商一致后签订了一份补充协议，将货物总价变更为150万元。在此情况下，只要补充协议的内容合法、双方意思表示真实一致，且不违反法律法规的强制性规定和公序良俗，那么该补充协议将优先于原合同中关于金额的条款。原合同中未被修改或废止的其他条款（如交货时间、质量标准等）仍然对双方具有法律约束力。
总结与建议：
当补充协议远超原合同金额时，原合同在未被明确修改或废止的部分仍然有效。补充协议在合法且双方自愿、平等签订的前提下，其效力优先于原合同中相冲突的部分。为避免未来可能出现的纠纷，建议双方在签订补充协议时明确约定相关条款，并遵循相关审批流程（如适用）。如有任何法律问题或疑问，请随时向我咨询。