一个刑事案件中存在多个辅办人并不违法，但需满足法定条件且程序合规；若存在违规情形，可通过内部监督或司法程序处理。具体分析如下：

1. 合法性前提：符合法定人员配置要求
   根据《刑事诉讼法》及相关司法解释，刑事案件的办理需遵循”主办+辅办”的分工模式。辅办人员通常指协助主办检察官/法官处理事务性工作（如证据整理、文书撰写）的辅助人员，其数量无强制上限，但需满足以下条件：

   • 辅办人员需具备法定资格（如通过司法考试、具有公务员身份）；
     
   • 辅办工作范围限于程序性事务，不得独立行使核心职权（如决定逮捕、提起公诉）；
     
   • 案件卷宗中需明确记载辅办人员参与情况及分工。
     若符合上述条件，多个辅办人参与案件不构成违法。

2. 违规情形及处理路径
   若出现以下情形，则可能涉及程序违法或职务违规：

   • 超范围履职：辅办人员实际行使主办职权（如独立讯问犯罪嫌疑人、签署法律文书），违反《人民检察院刑事诉讼规则》第4条关于”检察官办案责任制”的规定。
     处理方式：当事人可向检察院检察委员会或上级检察院提出书面异议，要求撤销违规行为并重新指派合格人员办理。
     
   • 利益冲突：辅办人员与案件当事人存在利害关系（如亲属关系、经济往来），违反《公务员法》第74条回避制度。
     处理方式：当事人可在知道回避事由后3日内提出回避申请，由办案机关负责人决定；对决定不服的可申请复议一次。
     
   • 人数滥用：为拖延办案期限或增加当事人负担，故意增设辅办岗位。
     处理方式：可依据《刑事诉讼法》第117条向同级或上级检察院提出控告，要求对超期办案或程序违规进行监督。

3. 实务建议

   • 当事人发现辅办人员违规时，应第一时间通过书面形式固定证据（如要求办案机关出具辅办人员授权书、记录违规行为发生时间地点）；
     
   • 若涉及重大利益（如可能被错误羁押），可同步向法院申请排除违规取得的证据（《刑事诉讼法》第58条）；
     
   • 对于系统性违规（如某检察院长期存在辅办人员越权办案），可向省级检察院或监察委进行实名举报。

如需进一步分析具体案件中的辅办人员行为是否合法，请提供案件类型（如公诉/自诉）、辅办人员具体参与环节等细节，我将结合《人民检察院办理刑事案件规定》等规范进行针对性解答。