关于农机车棚如何建设才合法的问题，这主要涉及到设施农用地的使用和管理规定。以下是一些关键信息和建议，供您参考：
首先，根据自然资源部、农业农村部印发的《关于设施农用地管理有关问题的通知》（自然资规〔2019〕4号），设施农业属于农业内部结构调整，其用地管理有一定的灵活性。但具体到农机车棚的建设，需要明确其是否属于设施农业的范畴，以及是否符合当地的相关规定。
用地性质：
- 如果农机车棚是作为农业生产的附属设施，且不破坏耕地耕作层，那么在一些情况下，可能可以使用一般耕地或永久基本农田（但需注意，破坏耕地耕作层且难以避让永久基本农田的，虽允许使用但必须补划）。
- 然而，具体能否在基本农田上建设农机车棚，还需根据当地的具体政策和规定来确定，因为不同地区可能有不同的执行标准和限制。
建设规模与标准：
- 设施农业用地的规模由各省（自治区、直辖市）自然资源主管部门会同农业农村主管部门根据生产规模和建设标准合理确定。因此，在建设农机车棚前，需要了解并遵守当地的相关规模和标准。
备案与审批：
- 设施农业用地需要由农村集体经济组织或经营者向乡镇政府备案，乡镇政府会定期汇总情况后汇交至县级自然资源主管部门。
- 如果涉及补划永久基本农田，还须经县级自然资源主管部门同意后方可动工建设。因此，在建设农机车棚前，务必按照流程进行备案和审批。
恢复原用途：
- 如果设施农业用地不再使用，必须恢复原用途。这意味着，如果农机车棚未来不再需要，您需要将其拆除并恢复土地的原状。
具体建议：
- 咨询当地部门：在建设农机车棚前，建议您先咨询当地的自然资源主管部门或农业农村主管部门，了解具体的政策规定和建设要求。
- 遵守规定：确保您的建设行为符合当地的相关规定和标准，避免违法用地和违规建设。
- 完善手续：按照流程进行备案和审批，确保您的建设行为合法合规。
综上所述，建设农机车棚的合法性取决于多个因素，包括用地性质、建设规模与标准、备案与审批等。为了确保您的建设行为合法合规，建议您在建设前充分了解并遵守当地的相关规定和标准。