民营企业应当配合纪委调查，这是基于法律规定和企业的社会责任所决定的。以下从多个角度对此问题进行分析：
一、法律义务角度
配合调查是法定义务：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》等相关法律法规，任何单位和个人都有义务配合司法机关的调查工作，包括纪委的调查。民营企业作为市场主体，同样需要遵守这一规定。
- 纪委在调查过程中，有权要求相关单位和个人提供必要的资料和协助。民营企业作为被调查对象或相关方，应当积极配合，提供真实、准确的资料和信息。
不配合的法律后果：
- 如果民营企业拒绝配合纪委的调查，可能会面临法律责任。根据情节轻重，可能会受到行政处罚、罚款等处罚措施。
- 在极端情况下，如果民营企业的行为构成妨碍公务等犯罪行为，还可能面临刑事追究。
二、社会责任角度
维护市场秩序：
- 民营企业作为市场主体，有责任维护市场的公平、公正和透明。配合纪委的调查，有助于揭露和打击违法违规行为，维护市场的正常秩序。
- 通过配合调查，民营企业可以展示其诚信经营、合规管理的形象，增强市场信任度。
促进企业健康发展：
- 配合纪委的调查，有助于民营企业及时发现和纠正自身存在的问题，避免潜在的法律风险和经营风险。
- 通过与纪委的沟通合作，民营企业可以更好地了解法律法规和政策要求，提升企业的合规管理水平，促进企业的健康发展。
三、实际操作建议
建立合规机制：
- 民营企业应建立健全合规管理机制，明确合规管理的职责和流程，确保企业在日常经营中能够遵守法律法规和政策要求。
- 通过定期培训和教育，提高员工的合规意识和法律素养，确保企业在面对纪委调查时能够迅速、准确地提供所需资料和信息。
积极沟通合作：
- 在面对纪委调查时，民营企业应保持积极、开放的态度，主动与纪委沟通合作，提供必要的协助和支持。
- 如果对调查内容或程序有疑问或异议，可以通过合法途径提出申诉或意见，但不应拒绝配合调查。
寻求专业法律支持：
- 在配合纪委调查的过程中，民营企业可以寻求专业律师的法律支持，确保企业的合法权益得到保障。
- 律师可以协助企业分析调查内容、提供法律意见、准备相关材料等，帮助企业更好地应对调查工作。
总结来看，民营企业应当配合纪委的调查工作，这既是企业的法律义务，也是其社会责任的体现。通过积极配合调查，民营企业可以维护市场秩序、促进自身健康发展，并避免潜在的法律风险和经营风险。如果您在配合纪委调查过程中遇到任何法律问题或困惑，可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律支持和建议。