结论：骗取国家有专项用途的资金并用于专项用途，若行为人具有非法占有的目的，并实施了虚构事实、隐瞒真相等骗取手段，仍可能构成犯罪，具体可能涉及诈骗罪、贪污罪等，需根据行为人的身份、行为方式及后果等具体情况来判断。
详细分析：
诈骗罪角度：
- 构成要件：诈骗罪要求行为人以非法占有为目的，通过虚构事实、隐瞒真相等手段骗取公私财物，且数额较大。在骗取国家专项资金的情况下，如果行为人编造虚假项目资料、伪造文件等手段骗取资金，即使资金最终用于了所谓的“专项用途”，但由于其获取资金的方式非法，且具有非法占有的目的（如意图通过欺骗手段获取不应得的资金），仍可能构成诈骗罪。
- 法律后果：根据《中华人民共和国刑法》第二百六十六条，诈骗公私财物，数额较大的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金；数额巨大或者有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；数额特别巨大或者有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金或者没收财产。
贪污罪角度（若行为人为国家工作人员）：
- 构成要件：贪污罪要求国家工作人员利用职务上的便利，侵吞、窃取、骗取或者以其他手段非法占有公共财物。在骗取国家专项资金的情况下，如果行为人是国家工作人员，且利用职务之便（如负责专项资金的审批、发放等）骗取资金归个人所有，即使资金原本应用于专项用途，但由于其非法占有的目的和行为，仍可能构成贪污罪。
- 法律后果：根据《中华人民共和国刑法》第三百八十二条和第三百八十三条，贪污罪的刑罚根据贪污数额和情节严重程度而定，从有期徒刑、拘役到无期徒刑，并可能并处罚金或没收财产。
其他罪名角度：
- 除了诈骗罪和贪污罪外，如果行为人的行为还涉及其他违法情形，如滥用职权、玩忽职守等，且给国家造成重大损失的，还可能构成滥用职权罪、玩忽职守罪等其他罪名。
法律建议：
- 严格遵守法律法规：无论是个人还是单位，在申请和使用国家专项资金时，都应严格遵守相关法律法规和规定，确保资金的合法获取和合规使用。
- 加强内部管理：对于负责专项资金审批、发放和使用的部门或单位，应加强内部管理，建立健全的审批、监管和审计机制，防止资金被非法骗取或挪用。
- 及时咨询专业律师：如果涉及骗取国家专项资金的问题或疑虑，应及时咨询专业律师，了解相关法律法规和规定，以便及时采取措施防范风险或应对法律纠纷。
可能后果：
- 如果行为人的行为构成犯罪，将面临刑事处罚，包括有期徒刑、拘役、罚金等。
- 骗取的资金将被依法追缴，并可能面临额外的罚款或没收财产等处罚。
- 行为人的个人声誉和职业生涯也可能受到严重影响。
总之，骗取国家有专项用途的资金并用于专项用途，并不意味着行为就合法或无罪。是否构成犯罪需根据行为人的身份、行为方式及后果等具体情况来判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。