企业破产时，若存在事业编职工，其处理方式需根据职工身份性质及法律规定分情况讨论，具体如下：

1. 事业编职工与企业劳动关系性质需明确
   事业编职工通常属于事业单位编制内人员，其劳动关系受《事业单位人事管理条例》调整，与企业破产程序中的普通劳动合同制职工存在本质区别。若该职工系事业单位委派至企业工作（如企业与事业单位存在关联关系），其劳动关系仍归属于原事业单位，企业破产不直接影响其编制身份及工资待遇，但需通过事业单位协调解决其工作安置问题。

2. 若事业编职工与企业存在双重劳动关系
   实践中存在少数情况：事业编职工在保留编制的同时，与企业另行签订劳动合同并实际提供劳动。此时需分两步处理：

   • 编制关系层面：原事业单位仍需履行人事管理职责，企业破产不导致其编制身份丧失；
     
   • 劳动合同层面：根据《劳动合同法》第44条，企业破产导致劳动合同终止的，企业应支付经济补偿（按工作年限×月工资标准），同时需优先清偿职工债权（包括工资、社保、经济补偿等）。但需注意，若该职工工资已由事业单位发放，企业可能无需重复支付工资部分，但需确认劳动合同中关于报酬的约定。

3. 特殊情形：企业为事业单位下属独立法人
   若破产企业系事业单位下属独立法人单位（如事业单位全资控股的企业），事业编职工可能通过“人事派遣”或“岗位借用”形式在企业工作。此时：

   • 劳动关系仍归属于事业单位，企业破产不改变其编制身份；
     
   • 职工可要求事业单位重新安排工作岗位，或依据《劳动合同法》第38条以“未提供劳动条件”为由解除劳动合同并主张经济补偿；
     
   • 若企业破产财产不足以清偿职工债权，根据《企业破产法》第113条，职工债权优先于普通债权受偿，但事业编职工的工资是否纳入破产债权需结合其劳动关系实际履行情况判断。

建议行动方向：

• 企业应梳理职工人事档案，明确其劳动关系归属（事业单位或企业）；
  
• 若涉及双重劳动关系，需与事业单位、职工三方协商，明确工资支付、经济补偿等责任主体；
  
• 管理人应依法申报职工债权，并优先清偿；若对职工身份存在争议，可申请劳动仲裁或诉讼确认劳动关系。
  

如有进一步细节（如职工具体工作形式、企业与事业单位关联性等），可继续向我咨询，我将结合具体情形提供更精准的分析。