挂靠单位被查可能会面临一系列严重的法律后果。首先，我们需要明确的是，挂靠行为本身是违法的，它违反了建筑市场的管理规定和相关法律法规。

一、行政处罚

当挂靠单位被查处时，相关部门，如住房城乡建设或专业工程行政主管部门，会依据法律法规对其进行处罚。具体来说，可能会责令停止违法行为，没收违法所得，并处以工程合同价款百分之二以上百分之四以下的罚款。此外，还可能责令停业整顿，降低资质等级；情节严重的，甚至会吊销资质证书。这些处罚措施旨在严厉打击挂靠行为，维护建筑市场的秩序和公平竞争。

二、法律责任

除了行政处罚外，挂靠单位还可能面临法律责任。例如，在涉及工资拖欠等劳动保障问题时，如果挂靠单位是名义上的用人单位，那么它可能需要承担支付工资等法律责任。即使实际承包人是挂靠者个人，但挂靠单位作为名义上的用人单位，仍然可能因挂靠行为而卷入法律纠纷，并承担相应的法律责任。

三、信誉损失

挂靠行为被查处后，挂靠单位的信誉也会受到严重影响。这可能导致其在未来的业务合作中受到排斥或限制，甚至可能面临业务萎缩、客户流失等严重后果。信誉是企业的无形资产，一旦受损，修复起来将非常困难。

四、案例警示

以某村边坡维护治理项目为例，施工单位甲施工队因挂靠行为被查处，并因拖欠民工工资而受到行政处罚。这一案例警示我们，挂靠行为不仅可能导致行政处罚和法律责任，还可能引发社会舆论的关注和谴责，对企业的声誉和形象造成极大损害。

五、建议

因此，我建议各施工单位要严格遵守相关法律法规，杜绝挂靠行为。同时，要加强内部管理，提高法律意识，确保企业的合法合规经营。对于已经存在挂靠行为的单位，应尽快整改并消除隐患，以避免不必要的法律风险和信誉损失。

总之，挂靠单位被查将面临严重的法律后果和信誉损失。各施工单位应高度重视这一问题，加强自我约束和管理，确保企业的健康稳定发展。