结论：车辆因线路短路造成自燃，保险公司是否赔偿需分情况讨论，主要取决于保险类型、保险条款约定以及事故具体情况。以下分情况详细说明：

1. 若投保了“车辆损失险”且未附加免责条款
   车辆损失险的保障范围通常包括“火灾、爆炸、自燃”等意外事故导致的车辆损失（具体以保险条款为准）。若线路短路属于车辆自身故障引发的自燃，且保险条款未将“线路老化、短路”列为免责事由，保险公司一般需赔偿车辆维修或报废损失。
   关键点：需证明自燃与线路短路的直接因果关系，且无免责情形（如车辆未按规定保养、私自改装线路等）。

2. 若投保了“自燃损失险”（附加险）
   自燃险是专门针对车辆因自身原因（如线路、油路故障）起火造成的损失设计的附加险。若投保此险种，线路短路引发的自燃通常属于理赔范围，但需注意：

   • 保险公司可能要求提供消防部门出具的《火灾原因认定书》，证明自燃非外部火源或人为纵火导致；
     
   • 若车辆存在私自改装、超负荷用电等行为，可能被拒赔。

3. 若仅投保“第三者责任险”或“交强险”
   第三者责任险仅赔偿因车辆事故导致第三方人身或财产损失，交强险同理；二者均不覆盖车辆自身损失。因此，线路短路自燃造成的本车损失，这两种保险不予赔偿。

4. 保险公司可能拒赔的常见情形

   • 车辆未按时年检或保养，导致线路老化未及时处理；
     
   • 车主私自改装电路（如加装大功率电器、非专业线路改动）；
     
   • 自燃由外部火源（如烟花爆竹、人为纵火）引发，与线路短路无关；
     
   • 保险条款明确将“线路故障”列为免责范围（需仔细阅读条款）。

建议行动：

1. 立即报警并联系消防部门，获取《火灾事故认定书》，明确自燃原因；
   
2. 联系保险公司报案，配合查勘定损，保留现场照片、维修记录等证据；
   
3. 若保险公司拒赔，可依据保险合同条款、事故认定书等材料，通过协商、投诉（如银保监会）或诉讼主张权利。
   

如有进一步细节（如保险条款内容、事故具体经过等），可随时向我咨询，我会结合具体情况为您分析。