结论：法人以个人名义给全资子公司打款并备注“代公司付款”，从法律和财务合规角度存在一定风险，是否可行需结合具体操作方式、资金性质及公司管理规范综合判断。以下分情况详细说明：

1. 若资金属于法人个人财产，且子公司无明确债务关系

• 法律风险：法人个人财产与公司财产需严格区分（公司法“法人财产独立”原则）。若法人将个人资金无偿借给子公司，需签订书面借款合同并明确利息（若无息可能被认定为赠与），否则可能被税务机关质疑资金往来的合理性（如视为分红需缴纳个税）。
• 财务合规：子公司收到款项后应计入“其他应付款-法人”，而非直接冲减成本或费用。若备注“代公司付款”但无合同支撑，可能被审计认定为“账外资金”或“虚假交易”。
• 建议操作：
  
  • 签订借款协议，明确借款金额、期限、利息（若有无息约定需合理说明）；
    
  • 子公司开具收款收据，备注“法人借款”并附协议复印件；
    
  • 避免直接备注“代公司付款”，改为“法人个人借款”以减少歧义。

2. 若资金实际属于母公司，法人仅作为“经手人”代付

• 法律风险：需证明资金所有权归属母公司（如母公司转账至法人个人账户的流水记录）。若无法证明，可能被认定为法人个人与子公司的交易，导致母公司资金流失风险。
• 财务合规：子公司应将款项计入“其他应付款-母公司”，并附母公司委托法人代付的书面文件（如付款指令函）。若直接备注“代公司付款”但无母公司确认文件，可能被认定为法人个人行为。
• 建议操作：
  
  • 母公司出具书面委托付款指令，明确代付金额、用途及子公司收款后需归还母公司的路径；
    
  • 法人代付后，子公司应立即将款项转回母公司（若需短期占用需签订三方协议）；
    
  • 保留母公司-法人-子公司之间的完整资金流水链，避免资金混同。

3. 税务合规关键点

• 增值税：若法人代付款项涉及子公司采购或服务，需确保子公司取得合法发票（开票方应为实际交易对方，而非法人个人）。
  
• 企业所得税：子公司需将款项性质准确计入账簿，避免因备注模糊导致税务机关调整应纳税所得额（如将借款误认为收入）。
  
• 个人所得税：若法人无偿借款给子公司，超过1年未归还且未用于生产经营，可能被税务机关认定为“视同分红”，需按20%税率缴纳个税。

4. 操作建议总结

• 优先通过公司账户转账：避免个人账户代付，减少财产混同风险。
  
• 完善书面文件：无论资金来源如何，均需签订借款协议或委托付款协议，明确权利义务。
  
• 规范财务处理：子公司应按实际资金性质入账，避免因备注误导审计或税务检查。
  
• 咨询专业机构：若涉及大额资金或复杂交易结构，建议提前与会计师、律师沟通设计合规方案。

如有进一步疑问（如具体交易背景、金额大小等），可直接向我说明，我会结合实际情况为您细化分析。