结论：若小额诉讼案件双方同意后判决，但当事人认为不适用小额诉讼程序，可以通过申请再审或向上一级法院申诉来寻求救济。

详细分析：

1. 小额诉讼程序的基本特点：

   • 小额诉讼程序是民事诉讼法中规定的一种简化程序，旨在快速、高效地解决标的额较小的民事纠纷。
   • 适用小额诉讼程序通常要求案件事实清楚、权利义务关系明确、争议不大，且标的额符合法定标准。

2. 当事人认为不适用小额诉讼程序的情况：

   • 如果当事人在判决后认为案件实际上并不符合小额诉讼程序的适用条件，例如案件事实复杂、争议较大，或者标的额超过了法定标准，那么当事人有权对程序适用提出异议。

3. 救济途径：

   • 申请再审：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，当事人对已经发生法律效力的判决、裁定，认为有错误的，可以向上一级人民法院申请再审。如果当事人认为小额诉讼程序的适用错误导致了判决的不公正，可以在法定期限内提出再审申请。
   • 向上一级法院申诉：除了申请再审外，当事人还可以向上一级法院提出申诉，请求对案件进行审查。虽然申诉并不直接启动再审程序，但它是当事人表达不满和寻求救济的一种方式，有时也能促使法院对案件进行重新审视。

4. 注意事项：

   • 时效性：当事人申请再审或申诉必须在法定期限内提出，否则将丧失救济机会。
   • 证据准备：当事人在提出再审申请或申诉时，应准备充分的证据来支持自己的主张，证明小额诉讼程序的适用确实存在错误。
   • 法律程序：当事人应严格按照法律程序进行申请再审或申诉，避免因程序不当而影响救济效果。

5. 实际操作建议：

   • 咨询专业律师：虽然这里我作为苏明煜律师已经给出了一些基本建议，但每个案件的具体情况都有所不同。因此，当事人在实际操作前最好咨询专业律师，以获取更具体、更个性化的法律建议。
   • 仔细审查案件材料：当事人在提出再审申请或申诉前，应仔细审查案件材料，确保自己的主张有充分的证据支持。
   • 保持沟通：在申请再审或申诉过程中，当事人应与法院保持沟通，及时了解案件进展情况，并根据法院的要求补充材料或提供进一步说明。

总结：若小额诉讼案件双方同意后判决，但当事人认为不适用小额诉讼程序，可以通过申请再审或向上一级法院申诉来寻求救济。在实际操作中，当事人应注意时效性、证据准备和法律程序等问题，并最好咨询专业律师以获取更具体的法律建议。如果你有进一步的法律问题或需要更详细的指导，可以直接向我咨询。