关于您提出的“分居证明女儿能否做证人”的问题，这实际上涉及到了法律程序中的证人资格问题，而非直接关于离婚证明书的申请流程，但我会尽量结合相关法律常识来为您详细解答。

首先，我们需要明确的是，在法律程序中，证人通常需要具备完全民事行为能力，能够客观、真实地陈述所知事实。对于未成年人，虽然他们可能观察到某些事实，但由于其心智发育尚未成熟，可能无法准确理解和表达所观察到的内容，因此在法律上对其作为证人的资格有一定限制。

针对您的情况，女儿作为未成年人，其证言在法律上的证明力可能会受到一定影响。法院在考虑是否采纳其证言时，会综合评估女儿的年龄、心智成熟度、对事实的理解能力以及证言的真实性和相关性等因素。如果女儿年龄较小，或者对分居等复杂情况的理解有限，那么她的证言可能不会被法院完全采纳。

此外，分居证明通常需要更直接、客观的证据来支持，如租房合同、水电费缴纳记录、双方通信记录等，这些证据能够更直接地证明双方确实处于分居状态。而女儿的证言，即使被采纳，也往往只是作为辅助证据之一。

如果您需要证明分居事实，我建议您收集更多客观、直接的证据，并咨询专业律师以获取更具体的法律建议。同时，如果您或您的配偶正在考虑离婚，并需要开具离婚证明书，您可以参考我之前提到的内丘县人民法院或巨鹿县人民法院的线上申领指南，通过正规渠道申请离婚证明书，以保护您的隐私和方便后续事务办理。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时告诉我。