您好，关于您提出的“与物流公司的挂靠合同解除后，登记证书怎么办”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，车辆登记证书是车辆所有权的重要法律凭证，但它并不等同于车辆所有权的绝对证明。在挂靠经营的情况下，虽然车辆可能登记在物流公司名下，但实际所有权可能仍属于您个人或您的企业。这一点在相关法律法规和司法实践中都有明确的体现，比如《中华人民共和国民法典》中关于动产物权设立和转让的规定，以及《公安部关于确定机动车所有权人问题的复函》等，都强调了车辆登记并非所有权登记。
当您与物流公司的挂靠合同解除后，关于车辆登记证书的处理，通常应遵循以下步骤：
协商处理：
- 您应首先与物流公司进行协商，明确双方对于车辆登记证书的归属和处理方式。如果合同中有明确约定，则按照合同约定执行；如果没有约定或约定不明确，则双方应友好协商，达成一致意见。
返还登记证书：
- 在协商一致或根据合同约定，物流公司应将车辆登记证书返还给您。这是您作为车辆实际所有权人应享有的权利。
办理过户手续（如需要）：
- 如果您希望将车辆过户到自己名下或其他指定主体名下，您需要与物流公司共同前往车辆管理所办理过户手续。在此过程中，您需要提供相关证明材料，如购车发票、车辆购置税完税证明、身份证等，以证明您对车辆的所有权。
法律途径：
- 如果物流公司拒绝返还车辆登记证书或拒绝配合办理过户手续，您可以通过法律途径维护自己的权益。您可以向法院提起诉讼，要求物流公司返还登记证书并配合办理过户手续。在诉讼过程中，您需要提供充分的证据证明您对车辆的所有权，如挂靠合同、购车款支付凭证、车辆使用记录等。
具体案例参考：
- 在某起挂靠经营合同纠纷案件中，原告与被告签订了货运车辆经营合同书，将车辆挂靠登记在被告名下。合同到期后，被告拒不配合原告办理过户登记手续。原告遂诉至法院，法院经审理后调解成功，被告当庭返还了原告车辆登记证书，并协助原告办理了车辆过户手续。
综上所述，当您与物流公司的挂靠合同解除后，您应首先与物流公司协商处理车辆登记证书的归属问题。如果协商无果或物流公司拒绝配合，您可以通过法律途径维护自己的权益。希望这些解答能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。