这份协议仍然是有效的。针对您提出的问题，我将从以下几个方面进行详细分析：
合同效力的基本原则：
- 合同的效力主要取决于合同双方是否具备相应的民事行为能力、意思表示是否真实、合同内容是否合法以及是否不违背公序良俗。只要这些条件满足，合同即具有法律效力。
- 在您描述的情况下，甲乙双方已经签订了合同，这表明双方已经就合同内容达成了一致，且没有提及存在影响合同效力的法定情形（如欺诈、胁迫、恶意串通等）。
合同份数与合同效力的关系：
- 合同的份数并不影响合同的效力。即使甲方没有给乙方一份合同，而是自己全部拿走，这并不改变合同已经成立并生效的事实。
- 合同份数主要是为了方便双方各自保存和履行合同，以及在发生争议时作为证据使用。它并不是合同生效的必要条件。
乙方的权益保障：
- 如果乙方担心甲方不履行合同或产生其他争议，乙方可以采取一些措施来保障自己的权益。例如，乙方可以要求甲方提供合同的复印件或扫描件作为证据，或者通过其他方式（如邮件、短信等）确认合同的内容。
- 在必要时，乙方还可以寻求法律途径来维护自己的权益，如提起诉讼或申请仲裁等。
可能的法律后果：
- 如果甲方因为未给乙方合同而拒绝履行合同义务或产生其他违约行为，甲方将需要承担相应的法律责任。这包括但不限于赔偿乙方因此遭受的损失、支付违约金等。
- 同时，如果乙方能够证明合同的存在和内容（即使没有原件），这通常也足以支持乙方在法律上的主张。
建议：
- 为了避免类似的争议和不便，建议在签订合同时，双方应各自保留一份合同原件或复印件。
- 如果甲方拒绝提供合同给乙方，乙方可以在签订合同时通过录音、录像或要求第三方见证等方式来记录合同的内容和签订过程，以作为未来可能的证据。
如果您在合同纠纷方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。