发现小区电动车后备箱被偷后，你可以按照以下步骤处理：

1. 立即报警并保护现场
   第一时间拨打110或前往辖区派出所报案，详细描述被盗时间、地点、物品特征（如后备箱品牌、颜色、内部物品等）。若现场有监控录像或目击者，及时向警方提供线索。报警记录是后续维权的关键证据，务必要求警方出具《受案回执》。

2. 联系物业调取监控或协助调查
   若小区有物业，要求其配合调取事发地点的监控录像，并保存相关证据。根据《民法典》第942条，物业对小区公共区域负有安全保障义务，若因物业未尽到管理职责（如监控损坏、安保巡逻缺失）导致被盗，可要求物业承担相应赔偿责任。

3. 核查保险理赔可能性
   若电动车投保了财产险（如车损险、附加盗抢险），需在24小时内向保险公司报案，并按照要求提供报警记录、购车发票、后备箱价值证明等材料。注意保险条款中的免赔额和理赔范围，例如部分保险可能对“非全车被盗”不予赔付。

4. 评估民事索赔路径
   若能锁定侵权人（如通过监控或警方调查），可直接向其提起民事诉讼，要求赔偿后备箱及内部物品的损失。若无法找到侵权人，但物业存在过错（如未安装监控、门禁形同虚设），可依据《民法典》第1198条，以“违反安全保障义务责任纠纷”为由起诉物业，要求其按过错程度赔偿。

5. 预防措施与证据留存

• 未来可加装防盗锁或GPS定位装置，降低被盗风险；
  
• 保存后备箱购买凭证、内部物品价值证明（如发票、照片），以便后续主张赔偿；
  
• 若小区多次发生盗窃，可联合业主向物业或业委会提出整改要求（如增加巡逻、修复监控），并留存书面沟通记录。

提示：若涉及金额较大（如后备箱内有贵重物品），建议同步委托律师介入，通过法律程序最大化维护权益。如有其他细节需要补充或进一步分析，可直接向我咨询。