结论：时任村长去追究二十几年前你父亲欠居委会的钱，这一行为是否合法，需分情况讨论，一般情况下，若已过诉讼时效且无特殊情形，村长无权再追究；若存在诉讼时效中断、中止等情形，或债务未过诉讼时效，则村长可能代表居委会进行合法追讨。以下为详细分析：
一、诉讼时效的基本规定
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。对于民间借贷等债务纠纷，如果债权人在诉讼时效期间内未行使请求权，即未向债务人主张权利，那么诉讼时效期间届满后，债务人可以提出不履行义务的抗辩。
二、二十几年前的债务是否已过诉讼时效
一般情况：
- 如果居委会在你父亲借款后二十几年内都未向你父亲主张过权利，且没有诉讼时效中断、中止等法定情形，那么该债务很可能已经超过了诉讼时效期间。
- 在这种情况下，即使村长现在代表居委会来追究这笔债务，你父亲也可以提出诉讼时效抗辩，拒绝履行还款义务。
特殊情况：
- 如果在这二十几年间，居委会曾经向你父亲主张过权利（如发送催款通知、提起诉讼等），或者存在其他诉讼时效中断、中止的情形（如你父亲同意履行债务、发生不可抗力等），那么诉讼时效可能会重新计算或中断，债务可能未过诉讼时效。
- 在这种情况下，村长代表居委会来追究债务可能是合法的，你父亲需要履行还款义务。
三、村长的行为是否合法
村长代表居委会的权限：
- 村长作为居委会的负责人或成员，如果得到居委会的授权或委托，可以代表居委会处理相关事务，包括追讨债务。
- 但如果村长未经授权或委托，擅自以个人名义或居委会名义来追究债务，则可能构成无权代理或越权行为，其行为的合法性会受到质疑。
村长行为的合法性判断：
- 如果债务已过诉讼时效且无特殊情形，村长无权再追究，其行为可能构成对债务人合法权益的侵害。
- 如果债务未过诉讼时效或存在诉讼时效中断、中止等情形，村长代表居委会进行合法追讨则是其职责所在，行为合法。
四、建议与应对措施
核实债务情况：
- 首先，你需要核实你父亲与居委会之间的债务情况，包括借款金额、借款时间、还款情况等。
- 同时，了解居委会在这二十几年间是否曾经向你父亲主张过权利，以及是否存在诉讼时效中断、中止等情形。
咨询专业律师：
- 如果你对债务情况或诉讼时效问题存在疑问，建议咨询专业律师以获取更准确的法律意见。
- 律师可以根据你提供的具体情况，分析债务是否已过诉讼时效，以及村长的行为是否合法。
应对措施：
- 如果债务已过诉讼时效且无特殊情形，你可以拒绝履行还款义务，并告知村长或居委会相关法律规定。
- 如果债务未过诉讼时效或存在争议，建议与居委会协商解决或通过法律途径解决纠纷。
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