祖坟被别人故意破坏，行为人将依法承担民事责任、行政处罚，甚至刑事责任，具体责任形式依据行为情节、损害后果及社会影响等因素综合判定。以下是对此问题的详细法律分析和处理建议：
一、民事法律方面
- 侵害物权与人格权益：
- 祖坟作为具有特殊纪念意义的特定物，承载着家族的精神寄托，被视为特殊财产权益。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，故意损坏祖坟构成对物权的侵害。受损方有权要求侵权人停止侵害、恢复原状（即修复至原状态）并赔偿损失，这些损失包括修复费用以及可能的精神损害赔偿。
- 精神损害赔偿的依据在于民法典第一千一百八十三条，该条款规定，因侵权行为造成严重精神损害的，被侵权人有权请求赔偿。赔偿数额将根据侵权人的过错程度、侵权行为造成的后果等因素进行酌定。
二、行政法律方面
- 治安管理处罚：
- 依据《中华人民共和国治安管理处罚法》的相关规定，故意损坏他人祖坟的行为可能面临五日以上十日以下拘留，并可并处五百元以下罚款的处罚；若情节较重，如破坏手段恶劣、后果严重或社会影响恶劣等，则可能面临十日以上十五日以下拘留，并可并处一千元以下罚款的处罚。
三、刑事法律方面
- 刑事责任：
- 根据《中华人民共和国刑法》第三百零二条的规定，盗窃、侮辱、故意毁坏尸体、尸骨、骨灰的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制。若故意损坏祖坟的行为达到此标准，如涉及对尸骨或骨灰的侮辱性处理，行为人将面临刑事处罚。
- 刑事责任的承担需综合考虑行为人的主观故意、情节严重程度及对受害者造成的精神和物质损害等多方面因素。
四、综合处理建议
收集证据：
- 在发现祖坟被破坏后，应立即报警并保护好现场，以便警方进行调查取证。同时，可以拍摄现场照片、视频等作为证据，以证明侵权行为的存在和损害后果。
协商与调解：
- 在警方介入后，可以尝试与侵权人进行协商，寻求和解或调解。如果双方能够达成一致意见，可以签订和解协议或调解书，以明确双方的权利和义务。
提起诉讼：
- 如果协商或调解无果，受损方可以向人民法院提起诉讼，要求侵权人承担民事责任、行政责任或刑事责任。在诉讼过程中，需要提供充分的证据来证明侵权行为的存在和损害后果，以及侵权人的过错程度等。
尊重法律与习俗：
- 在处理此类纠纷时，应尊重法律和当地习俗，避免采取过激行为或言语攻击等不当方式。同时，也应尊重他人的合法权益和尊严，避免实施类似破坏行为。
总结来说，祖坟被别人故意破坏是一个严重的违法行为，涉及民事、行政及刑事多方面的法律责任。在处理此类纠纷时，应依法行事，通过合法途径维护自己的权益。如果您在此方面遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。