结论：定向医学生在服务期限未到的情况下辞职读研，是否需要赔偿违约金以及赔偿的具体金额，需根据是否签订服务期协议、协议中的具体条款以及是否给单位造成损失等多个因素综合判断。以下是从不同角度的详细分析：
一、赔偿的前提与依据
服务期协议：
- 定向医学生与用人单位（如医院或卫生部门）通常会签订服务期协议，明确服务期限及双方的权利义务。若在服务期内辞职，且协议中有明确约定违约责任的，通常需按协议支付违约金。
- 违约金数额的限制：根据相关法律法规，违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用，且应与未履行的服务期限相对应。这意味着，违约金的计算并非随意，而是有一定的法律依据和限制。
竞业限制约定（如适用）：
- 若定向医学生的辞职违反了竞业限制约定（虽然这种情况在医学定向生中较为少见），也需支付违约金。但竞业限制通常适用于高级管理人员或掌握核心技术的员工，定向医学生一般不受此限制。
正常辞职且无损失：
- 若定向医学生能够证明其辞职是出于合理原因，且未给单位造成直接经济损失，则可能无需承担赔偿责任。但这种情况较为少见，因为定向医学生的辞职通常会被视为违约行为。
二、违约金的计算与标准
上限规定：
- 违约金的数额不得超过用人单位实际提供的培训费用，且通常不得超过当事人实际损失的百分之三十。这一规定旨在保护劳动者的合法权益，防止用人单位滥用违约金条款。
实际支出分摊：
- 违约金应按照服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用来计算。这包括确切的培训支出、差旅开支及其他直接费用。例如，如果用人单位为定向医学生提供了为期五年的培训，总费用为50万元，而定向医学生只履行了两年服务期，那么剩余三年的培训费用分摊到每年就是10万元，若定向医学生提前一年辞职，则可能需要支付10万元的违约金（具体数额还需根据协议约定调整）。
三、具体赔偿内容的确定
返还资助及福利待遇：
- 定向医学生在培养过程中接受的政府、单位或其他机构的专项资助，辞职时可能需按比例返还剩余服务期对应的资助款项。例如，如果定向医学生获得了10万元的奖学金或生活补助，且服务期为五年，已履行两年，则可能需要返还剩余三年的资助款项，即6万元。
- 特殊福利待遇如住房补贴、科研经费等，在辞职时也需根据具体情况退还或补偿。
赔偿单位损失：
- 若定向医学生的辞职导致单位培训投入无法得到回报或造成业务损失，定向医学生可能需赔偿单位的培训损失和业务损失。但这一赔偿需有充分证据支持，并与辞职行为存在直接因果关系。
四、法律程序与争议解决
协商解决：
- 建议定向医学生与用人单位首先通过友好协商解决争议。可以综合考虑解除聘用合同的原因、实际支出、实际工作服务年限等因素，达成一致的赔偿方案。
劳动仲裁或诉讼：
- 若协商不成，用人单位可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求定向医学生承担赔偿责任。
- 对仲裁裁决不服的，双方可向人民法院提起诉讼。在仲裁或诉讼过程中，双方需提供充分证据支持自己的主张。
五、实际操作建议
仔细研究合同：
- 定向医学生在考虑辞职前，应首先仔细阅读当初签订的协议条款，特别是关于服务期限和违约责任的部分。
沟通协商：
- 如有必要，可与用人单位进行沟通协商，尝试达成一致意见以减少损失。这可以包括协商调整服务期限、支付部分违约金或其他解决方案。
评估违约成本：
- 在决定辞职前，定向医学生应评估违约成本，包括可能支付的违约金、返还的资助款项以及可能面临的法律后果等。
遵守程序办理：
- 如果最终决定辞职，应按照单位或相关部门的规定进行办理，包括提交辞职申请、办理工作交接、转移档案和社保关系等。
示例说明：假设定向医学生小李与某医院签订了五年的服务期协议，医院为其提供了总计50万元的培训费用。小李在履行了两年服务期后，决定辞职读研。根据协议约定，小李可能需要支付剩余三年服务期对应的培训费用作为违约金，即30万元（但具体数额还需根据协议中的违约金计算方式调整）。若小李能够证明其辞职是出于合理原因，且未给医院造成直接经济损失，则可能通过协商减少赔偿金额。
总结：定向医学生在服务期限未到的情况下辞职读研，是否需要赔偿违约金以及赔偿的具体金额，需根据协议约定、实际支出以及是否给单位造成损失等多个因素综合判断。在处理此类问题时，建议定向医学生仔细研究合同条款、与用人单位沟通协商，并评估违约成本后再做出决策。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。