农村修路占用农民耕地，农民不同意是否合法，需根据具体情况来判断。以下是从不同角度进行的详细分析：
一、合法情形
履行法定审批程序并给予合理补偿：
- 如果修路项目是为了公共利益，如改善农村交通条件、促进经济发展等，并且已经依法办理了农用地转用审批手续，获得了县级以上人民政府自然资源主管部门的批准文件，同时给予了农民合理、足额的补偿（包括土地补偿费、安置补助费以及地上附着物和青苗的补偿费等），那么农民原则上应支持修路工作，此时农民不同意可能不构成合法阻碍。
- 举例：政府为改善偏远地区农产品运输问题而修建公路，提供了市场价值的补偿，农民应积极配合。
在规划范围内进行且符合规划要求：
- 修路项目必须在规划确定的线路和用地区域内进行，不得擅自超出范围。如果修路项目符合土地利用总体规划和乡村规划，且修路的用途与规划目的相符，那么农民不同意可能缺乏合法依据。
二、可以不同意或构成合法阻碍的情形
补偿不合理或未补偿：
- 如果补偿明显低于土地实际价值或未按规定标准和方式补偿，农民有权拒绝并要求重新协商合理补偿方案。此时，农民不同意修路占用其耕地是合法的，因为他们的合法权益受到了侵害。
- 举例：按过时价格补偿而未考虑土地增值，农民可要求按当前市场价格重新制定补偿标准。
未履行法定审批程序：
- 如果修路项目未经法定的农用地转用审批，擅自占用耕地修建乡村公路，那么这种行为属于违法行为。农民有权拒绝并可以通过法律途径维护自身权益，如向相关部门举报或提起行政诉讼。
超出规划范围占用：
- 如果修路项目超出了规划批准的范围占用耕地，那么多占的部分属于违法占地行为。农民有权拒绝并要求恢复土地原状或获得相应补偿。
三、农民维权的合法途径
- 查看审批程序：农民可以要求查看修路项目的审批文件，确认其是否合法审批。如果无合法审批手续，农民可以拒绝占地并要求恢复原状。
- 协商补偿：农民可以主动与修路方协商合理补偿方案，清晰表达自己的诉求和期望，争取获得公正的补偿。
- 申请裁决：如果协商不成，农民可以向房屋拆迁管理部门申请裁决，以获得公正的评估和补偿方案。
- 行政复议与行政诉讼：如果对裁决结果不服，农民可以向人民政府申请行政复议或向法院提起行政诉讼，维护自己的合法权益。
四、重要提示
- 农民在维权过程中应保留好相关证据，如土地使用证、损失照片、补偿协议等，以支持自己的诉求。
- 农民应注意维权途径与时效，确保在法定期限内提出自己的诉求和申请，以免错过维权时机。
总结来说，农村修路占用农民耕地时，农民是否同意取决于修路项目的合法性、补偿的合理性以及是否履行了法定程序。如果修路项目合法且补偿合理，农民应支持；如果修路项目违法或补偿不合理，农民有权拒绝并通过法律途径维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。