农村土地赔偿款截留20%是否合法需分情况讨论，核心取决于截留主体、程序及用途是否符合法律规定。以下从法律角度展开具体分析：

1. 若截留主体为村集体且符合法定程序，可能存在合法情形

根据《村民委员会组织法》第二十四条，涉及村民利益的下列事项，须经村民会议讨论决定方可办理：

• 土地补偿费的使用、分配方案；
• 宅基地的使用方案；
• 其他涉及村民利益的事项。

具体分析：

• 若村集体通过民主议定程序（如村民会议或村民代表会议）决定截留20%土地赔偿款，且截留资金用于公共利益支出（如修路、水利设施、教育医疗等），且符合地方性法规或政策规定的比例上限，则可能被认定为合法。
• 关键点：截留比例需有明确法律依据或政策支持，且程序必须合法（如提前公示、村民表决通过等）。

2. 若截留主体为政府或相关部门，则可能涉嫌违法

根据《土地管理法》第四十八条，征收土地应当依法及时足额支付土地补偿费、安置补助费以及农村村民住宅、其他地上附着物和青苗等的补偿费用，并安排被征地农民的社会保障费用。

具体分析：

• 政府或相关部门无权直接截留土地赔偿款，除非存在以下情形：
  • 法律明确授权（如代扣代缴税费、社会保障费用等）；
  • 法院判决或仲裁裁决要求扣留部分款项；
  • 村民与政府签订的补偿协议中明确约定截留比例及用途。
• 若截留行为缺乏法律依据或程序违法（如未公示、未征得村民同意），则可能构成行政违法，村民有权通过行政复议或行政诉讼主张权利。

3. 若截留资金被挪用或私分，则涉嫌刑事犯罪

根据《刑法》第二百七十二条，村集体经济组织工作人员利用职务上的便利，挪用本单位资金归个人使用或进行非法活动，数额较大、超过三个月未还的，构成挪用资金罪；若截留资金被私分，则可能涉嫌职务侵占罪或贪污罪（视主体身份而定）。

具体分析：

• 截留行为若伴随资金挪用、私分或贪污，则超出民事纠纷范畴，需依法追究刑事责任。
• 村民可向纪检监察机关举报或直接向公安机关报案，要求查处违法行为。

4. 实务建议

• 核查截留依据：要求截留方出示书面文件（如村民会议决议、政府批文、补偿协议等），明确截留比例、用途及程序合法性。
• 协商解决：若截留行为合法但村民有异议，可通过村民会议重新表决或协商调整分配方案。
• 法律救济：若截留行为违法，村民可向乡镇政府或县级自然资源部门申请行政复议，或直接向法院提起行政诉讼；若涉及刑事犯罪，可向公安机关报案。

总结：农村土地赔偿款截留20%是否合法，需结合截留主体、程序、用途及法律依据综合判断。若您遇到此类问题，建议提供具体细节（如截留主体、文件依据等），以便进一步分析。