若伤害案嫌疑人在三年后发现被诬陷，可采取以下法律措施维护自身权益：

1. 立即向公安机关报案或申请复查
   根据《刑事诉讼法》第110条，任何单位和个人发现犯罪事实或犯罪嫌疑人，有权利也有义务向公安机关报案。若您有新证据（如证人证言、物证、监控录像等）证明原指控系诬陷，可要求公安机关重新立案侦查。公安机关需在7日内决定是否立案，若不立案应出具《不予立案通知书》，您可据此申请复议或向检察院申诉。

2. 申请检察院法律监督
   若公安机关不予立案或案件处理存在争议，可依据《刑事诉讼法》第113条向同级人民检察院提出立案监督申请。检察院需在7日内要求公安机关说明不立案理由，若理由不成立，应通知公安机关立案。此途径可有效推动案件重启调查。

3. 提起刑事自诉或民事诉讼

   • 刑事自诉：若诬陷行为构成《刑法》第243条诬告陷害罪（需满足“捏造事实诬告陷害他人，意图使他人受刑事追究”且情节严重），您可直接向法院提起刑事自诉，要求追究诬告者刑事责任。
     
   • 民事诉讼：若诬陷行为导致您名誉受损或经济损失，可依据《民法典》第1024条、第1165条提起名誉权纠纷或侵权责任纠纷诉讼，要求诬告者赔礼道歉、消除影响并赔偿损失。

4. 申请国家赔偿（若原案件已进入刑事程序）
   若您曾因诬陷被错误羁押或判处刑罚，且原案件已通过再审改判无罪，可依据《国家赔偿法》第17条向作出错误决定的机关申请国家赔偿。赔偿范围包括人身自由赔偿金、精神损害抚慰金等。

关键注意事项：

• 证据收集：所有救济途径均依赖证据，需优先固定诬陷证据（如原始聊天记录、录音录像、证人联系方式等），避免证据灭失。
  
• 时效问题：刑事自诉需在追诉时效内提出（诬告陷害罪法定最高刑为3年有期徒刑，追诉时效为5年）；民事诉讼时效为3年，自知道权利受损之日起计算。
  
• 律师协助：刑事案件程序复杂，建议委托律师协助调取证据、撰写法律文书、参与诉讼程序，以提高维权效率。

若您有具体证据或案件细节，可进一步向我说明，我将为您分析证据效力并制定针对性方案。