农民工工资并非必须由总包单位代发，但在工程建设领域，推行分包单位农民工工资委托施工总承包单位代发制度。以下是对这一问题的详细分析：
法律依据与制度背景
根据《保障农民工工资支付条例》的相关规定，工程建设领域推行分包单位农民工工资委托施工总承包单位代发制度。这一制度设计旨在保障农民工的合法权益，减少工资拖欠现象，促进建筑行业的健康发展。具体来说：
总包单位代发工资的意义与影响
保障农民工权益：总包单位代发工资减少了工资发放的中间环节，降低了被拖欠工资的风险，确保了农民工能够及时、足额收到工资，保障了其基本生活和合法权益。
规范建筑市场秩序：这一制度有助于规范建筑市场秩序，减少因工资纠纷引发的社会不稳定因素，提升建筑行业的整体形象和信誉。
强化总包单位责任：总包单位对分包单位的劳动用工和工资发放情况负有监督责任。若分包单位拖欠农民工工资，施工总承包单位需先行清偿，再依法进行追偿。这一规定强化了总包单位在保障农民工工资支付中的关键地位。
实际操作中的注意事项
设立专用账户：总包单位需在工程项目所在地银行开设“农民工工资专用账户”，此账户专款专用，仅用于支付该项目农民工的工资，确保资金的安全与合规性。
编制与提交工资支付表：分包单位需按月考核农民工的工作量，并据此编制包含农民工姓名、身份证号、工作天数、应发工资等信息的工资支付表。该表需经农民工本人签字确认后，连同当月工程进度情况一并提交给总包单位。
审核与代发工资：总包单位对分包单位提交的工资支付表进行审核，确认无误后，通过农民工工资专用账户将工资直接支付到农民工本人的银行账户。同时，向分包单位提供代发工资凭证，详细记录工资发放的明细。
特殊情况下的处理
虽然《保障农民工工资支付条例》推行了总包单位代发工资的制度，但在实际操作中，如果分包单位与农民工之间有明确的工资支付约定，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么分包单位也可以直接向农民工支付工资。然而，在这种情况下，分包单位需要确保工资支付的及时性和足额性，并承担相应的法律责任。
总结与建议：
总包单位代发农民工工资是符合法律规定且行之有效的措施，旨在保障农民工的合法权益。然而，在实际操作中，也需要根据具体情况进行灵活处理。如果您在农民工工资支付方面遇到任何问题或纠纷，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议和帮助。