若软著登记过程中被查出存在造假行为，将面临行政处罚、民事赔偿以及可能的刑事责任，具体处理方式如下：
行政处罚：
- 根据《计算机软件保护条例》第二十四条的规定，如果提交的申请文件存在虚假内容，软件登记管理机构将不予登记并公告。
- 对于已经登记的，软件登记管理机构将撤销登记，并予以公告。这意味着造假者将失去通过软著登记所获得的法律保护和权益。
- 此外，根据《计算机软件著作权登记办法》第二十三条，国家版权局还会根据情况给予行政处罚，包括警告、罚款等。罚款的数额会根据违法行为的情节轻重而定，一般在一万元以上三万元以下。
民事赔偿：
- 如果造假行为给其他软件开发者或权利人造成了经济损失，造假者还需要承担民事赔偿责任。
- 赔偿的范围通常包括权利人因侵权行为所遭受的直接经济损失，以及为制止侵权行为所支付的合理开支，如律师费、公证费等。
刑事责任：
- 在极端情况下，如果造假行为构成犯罪，如诈骗罪或侵犯著作权罪，造假者还将面临刑事责任的追究。
- 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，诈骗公私财物数额较大的，可处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金；数额巨大或者有其他严重情节的，可处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。
- 如果造假行为被认定为侵犯著作权罪，且情节严重，造假者也可能面临类似的刑事处罚。
额外影响与建议：
- 信誉损失：软著登记造假还会对造假者的商业信誉和行业声誉造成严重影响，可能导致合作伙伴的流失和业务机会的减少。
- 合规建议：为了避免这些不利后果，建议软件开发者在申请软著登记时严格遵守相关法律法规和登记程序，确保申请文件的真实性和准确性。如果对软著登记流程或要求有疑问，可以寻求专业法律人士的帮助。
若您在软著登记过程中遇到任何法律问题或疑虑，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议和指导。