若股东以不动产出资，在破产时无法过户，可按以下情况处理：

1. 核查出资协议与前置条件
   首先需核查股东出资协议中是否约定了过户的前置条件（如公司完成特定经营目标、股东履行其他义务等）。若因未满足前置条件导致无法过户，管理人应依据《公司法》第28条，要求股东在合理期限内履行过户义务；若股东拒不履行，可追究其违约责任，要求赔偿公司损失（损失范围包括不动产市场价值与出资义务的差额）。

2. 评估无法过户的客观原因

   • 产权瑕疵：若不动产存在权属争议（如被查封、抵押或共有权人反对），管理人应依据《企业破产法》第18条，决定是否解除合同并要求股东返还已出资财产（若不动产已交付公司使用，可主张折价补偿）；若继续履行合同，需协调相关方解除权利限制。
     
   • 行政障碍：若因政策限制（如规划调整、环保要求）导致无法过户，管理人可依据《民法典》第580条，主张合同目的无法实现，要求股东以其他等值财产补足出资或赔偿损失。

3. 主张股东的资本充实责任
   根据《公司法司法解释（三）》第10条，若不动产已交付公司使用但未办理权属变更，公司、其他股东或债权人可要求股东在合理期限内办理过户；逾期未办理的，公司可主张其已履行出资义务，并要求将不动产纳入破产财产。若股东未交付且未过户，管理人可直接要求其履行出资义务，并追究其未全面出资的赔偿责任（赔偿范围以不动产评估价值为限）。

4. 破产财产的认定与分配
   若不动产最终无法过户，管理人应依据《企业破产法》第30条，将股东已交付公司使用的不动产纳入破产财产（按评估价值折现分配）；若未交付且未过户，股东的出资义务视为未履行，其债权在破产程序中需劣后于其他债权人受偿（依据《九民纪要》第118条关于“股东出资加速到期”的规定）。

实务建议：管理人应优先通过协商或诉讼推动过户；若确实无法过户，需及时固定证据（如出资协议、交付凭证、评估报告等），并在破产程序中依法主张股东的补充赔偿责任，以最大限度保障债权人利益。如有具体案例细节，可进一步向我咨询。