结论：股权代持协议中仅写明持股比例而未明确出资金额，该协议仍然有效，但可能因出资金额不明确而引发后续纠纷或执行上的困难。以下是对此问题的详细分析：
一、协议效力的分析
协议有效性不受单一条款缺失影响：
- 股权代持协议作为双方意思表示一致的产物，其整体效力并不因单一条款（如出资金额）的缺失而受到影响。只要协议内容不违反法律、行政法规的强制性规定，且双方意思表示真实，该协议即具有法律效力。
出资金额非协议生效的必备条款：
- 出资金额虽然对于确定股东权益和股权比例至关重要，但它并非股权代持协议生效的必备条款。协议中可以约定其他方式来确定股权比例，如通过协商、公司章程规定或实际出资情况等。
二、出资金额不明确可能带来的问题
股东权益确定困难：
- 出资金额是确定股东权益的基础。如果协议中未明确出资金额，那么在实际操作中，股东权益的确定可能会变得复杂和困难。这可能导致股东之间产生纠纷，影响公司的稳定运营。
股权比例调整争议：
- 在公司增资或减资时，股权比例的调整需要依据出资金额来进行。如果协议中未明确出资金额，那么股权比例的调整可能会引发争议，甚至导致法律诉讼。
实际出资情况难以证明：
- 如果协议中未明确出资金额，那么在实际出资时，股东可能需要提供额外的证据来证明其实际出资情况。这可能会增加股东的举证难度，甚至导致其权益无法得到充分保障。
三、应对措施与建议
协商明确出资金额：
- 双方可以通过协商来明确出资金额，并据此调整股权比例。这可以避免未来因出资金额不明确而引发的纠纷。
参考公司章程规定：
- 如果公司章程中有关于出资的规定，双方可以参照执行。这有助于确保股权代持协议与公司章程的一致性，减少法律风险。
签订补充协议：
- 双方可以签订补充协议，明确出资金额等关键条款。补充协议作为原协议的补充，具有与原协议同等的法律效力。
完善协议其他必要条款：
- 除了出资金额外，协议中还应明确双方的身份信息、代持关系说明等必要条款。这有助于进一步降低法律风险，确保代持股关系的稳定与合法。
举例说明：假设甲和乙签订了一份股权代持协议，约定甲代持乙在公司中的股权，但协议中仅写明了持股比例而未明确出资金额。后来，公司进行增资，甲和乙因股权比例调整问题产生争议。由于协议中未明确出资金额，双方无法直接依据协议来确定股权比例，只能通过协商、提供实际出资证据或参考公司章程规定等方式来解决争议。这增加了纠纷解决的复杂性和不确定性。
总结与建议：股权代持协议中仅写明持股比例而未明确出资金额，虽然协议仍然有效，但可能引发后续纠纷或执行上的困难。因此，建议双方在签订协议时，务必明确出资金额等关键条款，并完善协议其他必要信息。如果已经签订了此类协议，双方应及时通过协商、签订补充协议等方式来明确出资金额，以降低法律风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。