公司收取房租但未开具发票的行为不合法。以下从不同角度为你详细分析：

1. 从税务法规角度
   根据《中华人民共和国发票管理办法》第十九条规定，销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，对外发生经营业务收取款项，收款方应当向付款方开具发票。公司收取房租属于提供租赁服务并收取款项的经营行为，因此必须向承租方开具发票。若未开具，可能面临税务机关责令改正、罚款（最高1万元）等处罚，情节严重的还可能被没收违法所得。

2. 从合同履行角度
   若租赁合同中明确约定了“出租方需提供合法发票”的条款，公司未开具发票则构成违约。承租方有权依据《民法典》第五百七十七条要求出租方继续履行（补开发票）、赔偿损失（如因无法抵扣税款导致的额外税负），甚至在合同约定解除条件成就时主张解除合同。

3. 从承租方权益保护角度
   若公司未开具发票，承租方可能面临以下风险：

• 税务风险：企业承租方若将房租计入成本但无法取得发票，可能导致企业所得税前无法扣除，增加税负；
  
• 财务合规风险：无发票的支出可能被税务机关认定为“白条入账”，违反《会计法》第十四条关于“原始凭证必须合法有效”的规定，面临行政处罚；
  
• 维权障碍：若未来发生租赁纠纷，无发票可能影响承租方主张权利的证明力。

建议：

• 对公司而言，应立即补开发票并规范财务流程，避免税务和法律风险；
  
• 对承租方而言，可先与公司协商补开发票，若协商无果，可向当地税务机关举报（拨打12366纳税服务热线）或通过诉讼主张权利。
  

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