结论：对方在您补齐租金后仍拒绝归还车辆，这一行为一般是不合法的，但具体还需根据您与对方签订的以租代购合同中的相关条款来判断。

分析说明：

1. 合同关系基础：

   • 以租代购本质上是一种融资租赁或分期付款购车的方式，您与对方之间形成了租赁合同关系，同时可能也隐含了购车意向的协议。
   • 在租赁合同中，您作为承租人，有义务按照约定支付租金；对方作为出租人，有义务在您履行支付租金义务后，保证您对租赁物的正常使用。

2. 租金支付与车辆归还：

   • 您已经补齐了拖欠的两个月租金，这表明您已经履行了租赁合同中的主要支付义务。
   • 在您履行支付义务后，对方无正当理由拒绝归还车辆，这违反了租赁合同的基本原则，即承租人履行支付义务后，应享有对租赁物的正常使用权。

3. 合同条款的考量：

   • 虽然一般情况下对方的行为是不合法的，但具体还需查看您与对方签订的以租代购合同中是否有关于租金拖欠、车辆归还等特殊条款。
   • 如果合同中有明确规定，在租金拖欠达到一定期限后，对方有权解除合同并收回车辆，且该条款不违反法律法规的强制性规定，那么对方的行为可能在一定程度上具有合法性。但即便如此，对方也应在解除合同前通知您，并给予您合理的期限来补交租金或采取其他补救措施。

4. 法律后果与建议：

   • 如果对方无正当理由拒绝归还车辆，您有权要求对方继续履行合同，归还车辆，并可能要求对方承担因违约造成的损失。
   • 如果对方坚持不归还车辆，您可以考虑通过法律途径解决纠纷，如向法院提起诉讼或申请仲裁。
   • 在此过程中，建议您保留好所有与租赁合同相关的证据，如合同文本、租金支付凭证、沟通记录等，以便在需要时提供证明。

行动建议：

• 首先，再次与对方沟通，明确表达您已经补齐租金，要求对方立即归还车辆，并保留好沟通记录。
• 如果对方仍拒绝归还，您可以咨询专业律师（即我，吴桥山律师，专注于婚姻家庭、房产纠纷、债权债务领域），了解具体的法律程序和维权策略。
• 根据律师的建议，您可以考虑向法院提起诉讼或申请仲裁，以维护自己的合法权益。