结论：针对您两年前在公路上骑摩托车因路上积水滑倒摔伤的情况，能否索赔以及向谁索赔，主要取决于多个因素，包括积水的原因、责任方的确定以及诉讼时效等。以下我将从这几个方面为您详细分析。
一、积水原因与责任方确定
自然因素导致的积水：
- 如果积水是由于自然降雨等不可抗力因素造成的，且相关部门（如公路管理部门）已经尽到了合理的清理和警示义务，那么通常情况下，您可能难以直接向相关部门索赔。
- 但如果相关部门未能及时清理积水或未设置明显的警示标志，导致您因此摔伤，那么相关部门可能存在一定的过错，您有权向其索赔。
人为因素导致的积水：
- 如果积水是由于附近施工、排水系统故障等人为因素造成的，那么责任方可能是施工单位、排水系统管理单位等。
- 在这种情况下，您需要收集相关证据（如现场照片、视频、证人证言等），以证明积水是由特定责任方造成的，并且该积水是导致您摔伤的直接原因。
二、诉讼时效问题
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。这意味着，从您知道或应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算，您有三年的时间来提起诉讼。
- 在您的情况下，虽然事故已经发生两年，但如果您尚未超过诉讼时效期间，仍然有权向责任方提起诉讼要求赔偿。然而，如果超过了诉讼时效期间，您可能会失去胜诉权。
三、赔偿范围与计算
- 如果您能够确定责任方并成功提起诉讼，那么赔偿范围通常包括医疗费、误工费、护理费、交通费、住宿费、住院伙食补助费、必要的营养费等。
- 具体的赔偿金额需要根据您的实际损失和责任方的过错程度来确定。在计算赔偿金额时，您可以参考相关法律法规和司法解释的规定，以及当地的经济水平和赔偿标准。
四、建议与行动
- 收集证据：尽快收集与事故相关的证据，包括现场照片、视频、证人证言、医疗记录等。这些证据将有助于您证明事故的原因和责任方的过错。
- 咨询专业意见：由于事故已经发生两年，且涉及诉讼时效和赔偿范围等复杂问题，我建议您尽快咨询专业律师的意见。律师可以根据您的具体情况和当地法律法规，为您提供更详细的法律建议和诉讼策略。
- 考虑和解或调解：在提起诉讼之前，您也可以考虑与责任方进行和解或调解。这通常可以更快地解决纠纷，并减少诉讼成本和时间。
最后，我理解您可能对此事感到困惑和不安。作为专业律师，我擅长处理离婚和交通事故领域的法律问题。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会根据您的具体情况和当地法律法规，为您提供最专业、最全面的法律建议。