结论：消防未验收入住后，即使主动申办消防验收且通过验收，是否立案仍取决于多种因素，不能一概而论说不立案。以下从不同角度进行分析：
一、消防验收的法律规定与重要性
根据《中华人民共和国消防法》的相关规定，建筑物在投入使用前，必须经过消防验收合格，以确保其符合消防安全标准，保障人民群众的生命财产安全。消防验收是建筑物投入使用前的重要环节，对于预防火灾事故、减少火灾损失具有重要意义。
二、未经验收擅自入住的法律后果
行政处罚：如果建筑物在未经验收合格的情况下擅自投入使用，消防部门有权对其进行行政处罚，包括责令停止使用、罚款等。这种处罚是对违法行为的一种制裁，旨在促使建筑物所有者或使用者尽快补办消防验收手续，确保建筑物的消防安全。
立案可能性：在未经验收擅自入住的情况下，如果消防部门在检查中发现该违法行为，且认为情节严重，可能会将案件移送至相关部门进行立案处理。立案的目的是为了进一步调查违法行为，并根据调查结果作出相应的法律制裁。
三、主动申办消防验收且通过验收的影响
减轻处罚：如果建筑物所有者或使用者在未经验收擅自入住后，主动向消防部门申办消防验收，并且最终通过了验收，这表明其已经认识到了自己的违法行为，并采取了积极的措施进行纠正。在这种情况下，消防部门可能会根据具体情况，对其减轻或免除行政处罚。
立案与否的考量：然而，即使建筑物通过了消防验收，也不能完全排除立案的可能性。因为立案的考量因素不仅包括是否通过了消防验收，还包括违法行为的情节、后果、社会影响等多个方面。如果消防部门认为该违法行为情节严重、后果恶劣或社会影响较大，仍然可能会选择立案处理。
四、建议与措施
遵守法律法规：建筑物所有者或使用者应严格遵守消防法律法规，确保建筑物在投入使用前经过消防验收合格。这是预防火灾事故、保障人民群众生命财产安全的基本要求。
主动纠正违法行为：如果已经发生了未经验收擅自入住的违法行为，应尽快主动向消防部门申办消防验收，并积极配合消防部门的调查和处理工作。通过主动纠正违法行为，可以减轻或免除行政处罚，并降低立案的可能性。
咨询专业律师：在处理涉及消防验收和立案等法律问题时，建议咨询专业律师的意见。律师可以根据具体情况提供法律建议和指导，帮助建筑物所有者或使用者更好地维护自己的合法权益。
总结来说，消防未验收入住后，即使主动申办消防验收且通过验收，也不能完全排除立案的可能性。是否立案取决于多种因素，包括违法行为的情节、后果、社会影响等。因此，建筑物所有者或使用者应严格遵守消防法律法规，确保建筑物的消防安全，并在发生违法行为时主动纠正并咨询专业律师的意见。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。