超出面积交罚款后，该部分面积是否合法需分情况讨论，具体分析如下：

1. 若超出面积属于规划许可范围内的合理误差
   根据《城乡规划法》第六十四条，建设单位或个人若因施工误差导致实际建筑面积超出规划许可范围，但误差在合理限度内（通常为3%以内），且未影响相邻权、公共利益或城市规划的，经规划部门核实后，可通过补缴土地出让金、城市基础设施配套费等费用（即“罚款”性质款项）完成合法化手续。此时，超出部分面积在补缴费用后具有合法性。

2. 若超出面积属于违法建设
   若超出部分严重违反规划（如突破容积率、建筑高度限制等），或占用公共空间、耕地等禁止建设区域，即使缴纳罚款，该部分面积仍属于违法建筑。根据《行政处罚法》第二十八条，行政机关可责令限期拆除、没收实物或违法收入，并处罚款。此时，罚款仅是行政处罚手段，不赋予违法建筑合法性。

3. 特殊情形：历史遗留问题或政策宽容期
   部分地区对历史遗留的无证建筑或因政策调整导致的超面积问题，可能通过“罚款+补证”方式逐步合法化（如农村宅基地超面积处理）。但此类情形需以地方性法规或政策为依据，且通常要求超面积部分符合安全、消防等基本标准。

实务建议：

• 核实超面积的具体原因（施工误差、规划调整还是故意违建），以及是否已取得规划部门出具的《建设工程规划核实意见书》；
  
• 若涉及补缴费用，需明确费用性质（如土地出让金、罚款、配套费等）及计算依据，避免重复缴费；
  
• 若面临拆除风险，可主张“比例原则”（即拆除部分对整体建筑影响过大时，可争取罚款保留），但需以司法判决或地方政策为支撑。
  

如有具体案例或地方政策疑问，可直接向我咨询，我会结合细节进一步分析。