案子到检察院后，被扣押的车辆会根据不同情况依法处理，主要分为以下几种处理方式：

1. 作为证据使用
   如果车辆与案件直接相关（例如是作案工具、赃物或涉及犯罪行为的载体），检察院会将其作为证据随案移送至法院。在法院审理期间，车辆通常会被继续扣押，待判决生效后根据处理结果执行：

   • 若车辆被依法没收（如属于违法所得或供犯罪所用），将上缴国库或依法处置；
     
   • 若车辆与案件无关或需返还权利人，法院会判决解除扣押并退还。

2. 与案件无关需返还
   若车辆经审查认定与案件无关联（例如属于无辜第三方的合法财产），检察院应在3日内解除扣押，并通知车主或权利人领取。车主需凭身份证、车辆权属证明（如行驶证、购车合同）等材料办理返还手续。

3. 涉及财产保全或附带民事诉讼

   • 若案件存在附带民事诉讼（如交通事故赔偿、经济纠纷等），且车辆可能涉及赔偿执行，检察院可能根据法院要求继续扣押，待民事部分判决后依法处置；
     
   • 若车主本人是案件被害人（如车辆被盗窃后追回），检察院会协调返还车辆，并可能要求车主配合出具收条或确认书。

车主或权利人需注意的关键点：

• 及时沟通：若认为车辆被错误扣押，可向检察院提交书面异议，说明车辆与案件无关的证据（如购车发票、不在场证明等）；
  
• 配合调查：若车辆确与案件有关，需配合检察院或法院的调查、鉴定程序（如提供车辆使用记录、维修记录等）；
  
• 法律救济：若对扣押决定不服，可依法申请复议或提起诉讼，但需在法定期限内（通常为收到决定书后5日内）提出。

建议行动：

1. 携带车辆权属证明、身份证等材料，联系承办案件的检察院检察官，了解扣押具体原因及预计处理时间；
   
2. 若车辆被扣押影响正常生活（如唯一交通工具），可向检察院申请“临时使用”或提供担保换取车辆返还（需符合《刑事诉讼法》相关规定）；
   
3. 关注案件进展，若案件移送法院或作出判决，及时与法院联系确认车辆返还或处置事宜。
   

如有进一步疑问（如具体流程、证据提交要求等），可直接向我咨询，我会结合您的案件细节提供更精准的建议。