对于艾滋病人认罪认罚的情况，检察院会按照以下流程进行办理：

1. 确认认罪认罚的真实性与合法性：检察院首先会核实认罪认罚的自愿性、真实性和合法性，确保艾滋病人在完全理解自己行为后果的前提下，自愿认罪认罚，且未受到任何非法胁迫或诱导。

2. 评估病情与羁押必要性：考虑到艾滋病人的特殊病情，检察院会对其病情进行评估，并综合考虑是否需要对其采取羁押措施。若病情严重，可能涉及羁押必要性、医疗条件以及人道主义关怀等方面的考量，从而作出是否羁押的决定。

3. 依法从宽处理：根据《刑事诉讼法》及相关司法解释，认罪认罚的犯罪嫌疑人、被告人可以从宽处理。对于艾滋病人，若其认罪认罚，检察院在提起公诉时，会提出相应的从宽处罚建议，并在量刑建议中予以体现。

4. 保障诉讼权利：在办理过程中，检察院会充分保障艾滋病人的诉讼权利，包括知情权、辩护权、申诉权等，确保其能够依法参与诉讼活动，维护自身合法权益。

5. 特殊医疗与关怀：若艾滋病人被羁押，检察院会协调相关部门，确保其获得必要的医疗救治和人文关怀，保障其基本生活需求和健康权益。

综上所述，检察院在办理艾滋病人认罪认罚案件时，会综合考虑其病情、认罪认罚的自愿性与合法性，以及羁押必要性等因素，依法从宽处理，并充分保障其诉讼权利和特殊医疗需求。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。