若车架号不符合规定（如篡改、伪造或与登记信息不一致）且车辆闯红灯，处罚需分两步处理：先对车架号问题处罚，再对闯红灯行为处罚，两者可能合并执行。具体分析如下：
一、车架号不符合规定的法律定性及处罚
车架号（车辆识别代号VIN）是车辆的唯一身份标识，根据《道路交通安全法》第十六条及《机动车登记规定》第七十八条，任何单位或个人不得擅自改变机动车已登记的结构、构造或特征，包括车架号。若车架号被篡改、伪造或与登记信息不符，属于违法行为，处罚如下：
- 行政处罚：由公安机关交通管理部门责令恢复原状，并处500元以下罚款；若涉及伪造、变造车架号，可能面临1000元以下罚款及收缴伪造证件的处罚。
- 车辆处理：车辆可能被扣留，直至车架号恢复原状或提供合法证明；若无法恢复，车辆可能被强制报废。
- 刑事责任风险：若篡改车架号用于盗窃、拼装车辆等犯罪活动，可能构成《刑法》中的盗窃罪、生产销售伪劣产品罪等，需承担刑事责任。
二、闯红灯的处罚标准
根据《道路交通安全法》第三十八条及第九十条，闯红灯属于违反交通信号灯指示通行的行为，处罚如下：
- 行政处罚：罚款200元，并记6分（根据《机动车驾驶证申领和使用规定》）。
- 特殊情形：若因车架号问题导致车辆无法正常年检或保险失效，闯红灯时可能因“驾驶未按规定检验或保险的机动车”被叠加处罚（如罚款200元、扣3分）。
三、车架号问题与闯红灯的关联处罚
若车辆因车架号不符合规定被查处时同时存在闯红灯行为，公安机关可能合并处罚：
- 先处理车架号问题：责令恢复车架号、罚款，并扣留车辆；
- 再处理闯红灯行为：对闯红灯单独罚款200元、记6分；
- 合并执行：若车架号问题导致车辆被扣留，需先解决车架号问题才能处理闯红灯的违法记录。
四、实务建议
- 立即整改：若车架号被篡改或损坏，应尽快到车管所申请变更登记，恢复原始车架号；
- 保留证据：若车架号问题系他人伪造（如二手车交易中被隐瞒），需收集合同、聊天记录等证据，避免承担不必要的责任；
- 咨询专业律师：若对处罚有异议或涉及刑事风险，可进一步向我咨询，我会结合具体案情分析维权路径。
总结：车架号不符合规定本身会面临行政处罚，若同时闯红灯，需分别接受对车架号问题和闯红灯行为的处罚，两者可能合并执行。建议优先解决车架号合法性问题，再处理交通违法记录。