在合同中，如果甲方签名者与甲方不是同一人，这种情况通常是不被允许的，因为这涉及到合同主体的真实性和合法性。不过，针对这一问题的处理，可以从以下几个角度进行分析：

1. 合同效力的角度：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同应当是双方真实意思的表示，且合同主体应当具有相应的民事行为能力。如果甲方签名者并非甲方本人，且没有甲方的合法授权（如授权委托书），那么该签名可能被视为无效，进而影响整个合同的效力。
   • 建议：在签订合同时，务必确保签名者是合同主体本人或持有合法授权的人。如果确实需要由他人代签，应当事先取得合同主体的书面授权，并在合同中注明代签情况。

2. 代理关系的角度：

   • 如果甲方签名者是甲方的代理人，且该代理行为在甲方的授权范围内，那么该签名是有效的。但这种情况下，合同中应当明确注明代理关系，并附上甲方的授权委托书作为合同附件。
   • 建议：在涉及代理关系时，务必确保代理行为的合法性和有效性。代理人在签订合同时，应当出示甲方的授权委托书，并在合同中明确注明代理关系及代理权限。

3. 法律后果的角度：

   • 如果合同因签名者非甲方本人且无合法授权而被认定为无效，那么双方可能需要根据各自的过错程度承担相应的法律责任。例如，如果甲方存在过错（如未妥善保管授权委托书或未及时撤销代理权），可能需要承担一定的赔偿责任。
   • 建议：在签订合同前，双方应当仔细审查合同内容，确保合同主体的真实性和合法性。如果发现合同存在瑕疵或疑问，应当及时咨询专业律师或相关机构，以避免潜在的法律风险。

4. 实际操作的角度：

   • 在实际操作中，为了避免因签名者非甲方本人而引发的纠纷，双方可以在签订合同前进行身份验证或要求签名者出示相关身份证明文件。此外，还可以考虑采用电子签名等更加安全、便捷的签名方式。
   • 建议：在签订合同时，双方应当保持谨慎态度，确保合同签订过程的合法性和有效性。如果条件允许，可以邀请第三方机构或律师作为见证人，以增加合同的公信力和可执行性。

针对您提出的问题，如果合同中甲方签名者与甲方不是同一人，且没有甲方的合法授权，那么该合同可能因签名无效而影响整体效力。因此，在签订合同时，请务必确保签名者的真实性和合法性，以避免潜在的法律风险。如果您在合同签订过程中遇到任何疑问或问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。