在破产案件中，如果债权人对债权类别认定有异议，可以按照以下步骤进行处理：

一、了解法律规定

首先，债权人需要了解《企业破产法》及相关司法解释中关于债权认定异议的规定。根据《企业破产法》第五十八条，债权人对管理人认定的破产债权以及债权人会议核查的债权表记载的债权有异议的，可以向受理破产申请的人民法院提起诉讼。

二、提出异议并说明理由

在债权人会议核查债权表时，如果债权人对某项债权的类别认定有异议，应当立即向管理人提出，并说明异议的理由和法律依据。管理人会对异议进行解释或调整。

三、提起债权确认之诉

如果经管理人解释或调整后，债权人仍然不服，或者管理人不予解释或调整，那么债权人需要在债权人会议核查结束后十五日内向人民法院提起债权确认的诉讼。这一步骤是关键的，因为它涉及到债权人的合法权益能否得到保障。

四、注意诉讼期限

关于提起债权确认之诉的期限，根据《最高人民法院关于适用<中华人民共和国企业破产法>若干问题的规定（三）》第八条，异议人应当在债权人会议核查结束后十五日内向人民法院提起诉讼。这个期限是附不利后果的引导性规定，目的是督促异议人尽快提起诉讼，以便尽快解决债权争议，提高破产程序的效率。

如果异议人未在该十五日内提起债权确认的诉讼，将视为其同意债权人会议核查结果，破产程序将按债权人会议核查并经人民法院裁定确认的结果继续进行。这可能会给异议人的财产分配和行使表决权等带来不利后果，这些后果将由异议人自行承担。

五、与管理人和法院沟通

如果确实存在不可抗力等特殊情况导致无法在十五日内向法院起诉，债权人应及时与管理人、法院进行沟通、协商，并申请顺延起诉。管理人在此前提下，可通过采取暂缓确认债权、在破产财产分配时提存相应份额、申请法院赋予临时表决权等方式，保障异议人的合法权益，同时也保障了破产程序的有效推进。

六、关注法院审理流程

在提起债权确认之诉后，债权人需要密切关注法院的审理流程及所需时间，并充分做好各项准备工作，包括整理与其异议主张相关的各种证据资料等。

综上所述，债权人在对债权类别认定有异议时，应当及时、合法地提出异议，并按照法律规定的程序进行处理，以维护自己的合法权益。