结论：部队作为甲方是否有权查乙方账务，这并非一个简单的“是”或“否”的问题，而是需要根据双方签订的合同内容、相关法律法规以及具体情境来综合判断。
分析角度一：合同约定
合同条款：首先，需要查看双方签订的合同中是否有关于甲方（部队）有权检查乙方账务的明确条款。如果合同中有这样的约定，并且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么部队作为甲方就有权按照合同约定检查乙方的账务。
合同解释：如果合同中没有明确约定，但根据合同的性质、目的和交易习惯，可以合理推断出甲方有权检查乙方账务的，那么部队也可能享有这一权利。不过，这种推断需要谨慎，并且最好有法律专业人士的协助。
分析角度二：法律法规
一般规定：在一般情况下，没有法律法规直接规定甲方（部队）有权检查乙方账务。除非双方之间的合同关系受到特定法律法规的调整，并且这些法律法规明确规定了甲方的检查权。
特殊规定：如果部队与乙方之间的合同关系涉及到国家安全、军事秘密等特殊领域，可能会有相关的法律法规赋予部队特殊的检查权。但这种情况比较特殊，需要具体分析。
分析角度三：实际情境
合作性质：如果部队与乙方之间的合作是基于信任、互利共赢的原则，并且双方之间有着良好的合作历史，那么部队可能不会轻易行使检查乙方账务的权利，除非有充分的理由怀疑乙方存在违约或违法行为。
违约或违法行为：如果部队有合理的理由怀疑乙方存在违约或违法行为，比如乙方可能存在财务欺诈、挪用资金等行为，那么部队作为甲方有权根据合同约定或法律法规的规定，对乙方的账务进行检查，以维护自身的合法权益。
建议：
查看合同：首先，建议部队作为甲方仔细查看与乙方签订的合同，了解合同中是否有关于检查乙方账务的约定。
咨询法律专业人士：如果合同中没有明确约定，或者对合同条款的理解存在争议，建议部队咨询法律专业人士，了解自身的权利和义务，以及可能面临的法律风险。
谨慎行使权利：如果部队确实享有检查乙方账务的权利，也建议在行使这一权利时保持谨慎和合理，避免对乙方的正常经营造成不必要的干扰或损失。
后续思考：在实际操作中，部队作为甲方在行使检查乙方账务的权利时，还需要考虑如何确保检查的合法性和合规性，以及如何处理检查过程中可能发现的问题。这些问题都需要根据具体情况进行具体分析，并可能需要法律专业人士的协助。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。