结论前置：合同内有部分不做了，建议出具变更单，以确保合同变更的合法性和有效性，避免后续纠纷。以下从不同角度详细分析：
一、法律角度
合同变更的法律规定：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人协商一致，可以变更合同。合同变更应当遵循合法、公平、诚实信用的原则，并不得违反法律、行政法规的强制性规定。
- 合同变更通常需要以书面形式进行，尤其是涉及合同主要内容的变更，如标的、数量、质量、价款或报酬、履行期限、履行地点和方式、违约责任和解决争议方法等。
不出具变更单的法律后果：
- 如果合同部分内容不做了，但双方未出具变更单，可能导致原合同内容继续有效，而实际履行情况与合同不符，从而引发纠纷。
- 在纠纷发生时，由于缺乏书面变更证据，双方可能难以证明合同变更的事实和内容，增加诉讼风险和成本。
二、实务角度
出具变更单的好处：
- 明确变更内容：变更单可以详细记录合同变更的具体内容，包括变更的部分、变更的原因、变更后的履行方式等，有助于双方明确各自的权利和义务。
- 避免纠纷：通过出具变更单，可以确保双方对合同变更达成一致意见，减少因理解不一致而引发的纠纷。
- 作为证据：在纠纷发生时，变更单可以作为证明合同变更事实和内容的重要证据，有助于维护双方的合法权益。
不出具变更单可能面临的问题：
- 履行障碍：由于缺乏明确的变更指示，双方可能在履行过程中产生分歧，导致合同无法顺利履行。
- 证据不足：在纠纷发生时，由于缺乏书面变更证据，双方可能难以证明自己的主张，增加诉讼难度和不确定性。
三、建议与操作
- 及时沟通：当发现合同部分内容无法履行或需要变更时，应及时与对方沟通，说明变更的原因和必要性。
- 出具变更单：在双方达成一致意见后，应出具书面变更单，明确变更的内容、时间、方式等，并由双方签字或盖章确认。
- 保留证据：在出具变更单的同时，应保留好相关证据，如沟通记录、邮件、短信等，以备不时之需。
举例说明：假设甲乙双方签订了一份建设工程合同，约定由乙方负责施工某项目。在施工过程中，由于设计变更，部分工程内容不再需要施工。此时，甲乙双方应及时沟通，并出具书面变更单，明确不再施工的部分工程内容、变更后的价款调整等事项。这样，在后续履行过程中，双方就可以按照变更后的合同内容执行，避免纠纷的发生。
总结：合同内有部分不做了，出具变更单是明智之举。它不仅可以明确变更内容、避免纠纷，还可以作为证据维护双方的合法权益。因此，建议在实际操作中务必重视合同变更的书面确认工作。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。