核心结论：针对您描述的情况，补协议需明确原离婚协议中农村房产归属孩子的约定变更情况，即经双方同意将其中两间房归男方所有，以下是补协议的撰写要点及示例内容。

补协议撰写要点

1. 明确双方信息：写明夫妻双方的姓名、身份证号等基本信息，确保协议主体明确。
2. 说明原协议情况：简要提及原离婚协议中关于农村房产归孩子的约定内容，包括房产的具体位置、面积等信息，为后续变更做铺垫。
3. 阐述变更内容：清晰说明经双方协商一致，将原协议中归孩子的房产中的两间房变更归男方所有，要明确两间房的具体位置、房号等详细信息，避免产生歧义。
4. 约定其他事项：可以约定变更后的房产权利义务关系，如男方取得两间房后，对该房屋的维护、管理责任等；也可以约定若涉及房产后续拆迁等情况，相关权益的归属。
5. 明确生效条件：确定协议生效的时间或条件，例如双方签字后生效，或者办理相关登记手续后生效等。
6. 双方签字确认：协议最后需夫妻双方签字、捺印，并注明签订日期。

补协议示例

离婚协议补协议

男方：[男方姓名]，身份证号：[男方身份证号码] 女方：[女方姓名]，身份证号：[女方身份证号码]

男女双方于[原离婚协议签订日期]签订了《离婚协议书》，其中约定位于[农村房产具体地址，包括村、组、门牌号等]的农村房产（房产面积：[X]平方米）归双方子女[子女姓名]所有。现经双方友好协商，就该房产归属事宜达成如下补充协议：

一、变更内容

双方同意将原离婚协议中归子女[子女姓名]所有的上述农村房产中的[具体两间房的位置、房号，如东边第一间和第二间]两间房归男方[男方姓名]所有。

二、权利义务

1. 男方取得上述两间房后，负责该房屋的日常维护、管理，承担相应的费用。
2. 若该房产涉及拆迁等事宜，因该两间房所产生的拆迁补偿、安置等权益归男方所有。

三、生效条件

本补协议自双方签字之日起生效。

四、其他

本补协议一式两份，男女双方各执一份，具有同等法律效力。

男方（签字、捺印）：__________________ 日期：___年_月____日

女方（签字、捺印）：__________________ 日期：___年_月____日

在签订补协议时，双方要确保是自愿、平等协商的结果，且协议内容不违反法律法规的强制性规定和社会公共利益。如果对协议的撰写还有疑问，或者涉及更复杂的法律问题，都可以直接向我咨询。