在逾期支付工程款的情况下，是计算利息还是违约金，主要取决于合同中的约定以及相关法律法规的规定。以下是对此问题的详细分析：

一、合同有约定的情况

1. 违约金：

   • 如果建设工程施工合同中明确约定了逾期支付工程款的违约金计算方法或具体金额，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么应按照合同约定来确定违约金。例如，合同可能约定每逾期一日按未支付金额的万分之五支付违约金，或者约定一个固定的违约金数额。
   • 计算公式示例：若合同约定每逾期一日按未支付金额的万分之五支付违约金，未付款金额为100万元，逾期30天，则违约金=1000000×0.0005×30=15000元。

2. 利息与违约金并存：

   • 在某些情况下，合同可能同时约定了逾期利息和违约金。此时，如果两者之和不过分高于造成的损失，法院可能会支持同时主张。但一般而言，为了避免重复赔偿，法院可能会根据实际情况对两者进行适当调整。

二、合同无约定或约定不明确的情况

1. 利息：

   • 当合同没有约定或约定不明确时，根据相关法律规定，承包人可以要求发包人按照中国人民银行发布的同期同类贷款利率（现为全国银行间同业拆借中心公布的一年期贷款市场报价利率LPR）计算利息作为逾期付款的损失赔偿。
   • 计算公式示例：2023年10月，某工程欠款50万元，逾期60天，适用一年期LPR为3.45%，则逾期利息=500000×3.45%÷365×60≈2835.62元。

2. 实际损失：

   • 若承包人能证明因发包人逾期付款导致的实际损失超过了上述法定标准计算的金额，可以主张按照实际损失来计算赔偿。这需要提供充分的证据，如合同、付款凭证、追讨费用等，来证明损失的数额和关联性。

三、其他注意事项

1. 审查合同约定的有效性：

   • 在计算违约金或利息前，务必审查合同条款的合法性及有效性，避免无效条款导致的争议。例如，如果约定的违约金过高或过低，当事人可以请求法院或仲裁机构予以适当调整。

2. 及时主张权利：

   • 承包人应通过书面等方式及时向发包人主张违约金或利息，以维护自身合法权益。逾期主张可能会导致权利丧失或难以证明。

3. 协商与诉讼：

   • 若双方对违约金或利息的计算方式存在争议，应首先尝试协商解决；协商不成时，可通过诉讼或仲裁途径解决纠纷。在诉讼或仲裁过程中，法院或仲裁机构会根据合同约定、法律规定以及案件的具体情况来确定最终的赔偿金额。

总结与建议：在处理逾期支付工程款的问题时，应首先查看合同中的约定。如果合同有明确约定，则按照约定执行；如果合同无约定或约定不明确，则参照相关法律法规和行业标准来确定赔偿金额。同时，务必注意审查合同约定的有效性、及时主张权利以及通过协商或诉讼途径解决纠纷。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。