不能仅因怀疑对方是小三就申请查对方的账户。以下从几个方面为你详细解释：

法律程序与隐私保护

在法律程序中，个人隐私是受到严格保护的，这包括银行账户信息等敏感数据。除非有明确的法律依据和法定程序，否则任何单位或个人都无权随意查询他人的银行账户。怀疑对方是小三，这本身并不构成查询其银行账户的合法理由。

合法查询账户的情形

1. 法院调查令：在离婚诉讼等法律程序中，如果一方有合理理由怀疑对方存在转移财产、隐匿财产等行为，且这些行为可能影响到案件的公正处理，那么可以向法院申请调查令，要求银行提供相关账户信息。但这种情况需要严格的法律程序和证据支持，不是仅凭怀疑就能实现的。

2. 公安机关侦查：在刑事案件中，如果公安机关认为某人的银行账户与案件有关，且需要作为证据使用，那么可以依法进行查询。但这同样需要严格的法律程序和证据支持，与个人之间的怀疑无关。

怀疑“小三”时的合法途径

如果你怀疑对方是小三，并担心其可能涉及财产转移等问题，可以采取以下合法途径来维护自己的权益：

1. 收集证据：通过合法手段收集相关证据，如聊天记录、转账记录、照片等，以证明对方与你的配偶存在不正当关系，并可能涉及财产转移。

2. 咨询律师：在收集到一定证据后，可以咨询专业律师，了解如何通过法律途径来维护自己的权益。律师可以根据你的具体情况，为你提供专业的法律建议和诉讼策略。

3. 提起诉讼：如果证据充分，且符合法律规定的条件，你可以向法院提起诉讼，要求确认对方与你的配偶存在不正当关系，并请求法院对相关财产进行分割或追回。

可能的法律后果

如果你在没有合法依据的情况下，擅自查询他人的银行账户信息，可能会面临以下法律后果：

1. 侵犯隐私权：查询他人银行账户信息可能构成对他人隐私权的侵犯，需要承担相应的民事责任。

2. 违法犯罪：如果查询行为涉及非法获取、出售或提供公民个人信息等违法犯罪行为，还可能面临刑事责任的追究。

总结与建议：怀疑对方是小三并不能成为查询其银行账户的合法理由。如果你担心对方可能涉及财产转移等问题，应该通过合法途径来收集证据并维护自己的权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供专业的法律建议。